12.4: Självskarvning av grupp i introner (Pre‑rRNA av Tetrahymena)

Intron är katalysatorn för skarvning i detta System

RNA‑involvering i självskarvning är stökiometrisk, men den utskurna intron har en katalytisk aktivitet in vitro. Efter en serie intramolekylära cykliserings-och klyvningsreaktioner kan den linjära utskurna intron som saknar 19 nukleotider (kallad L-19 IV) användas katalytiskt för att lägga till och ta bort nukleotider till ett konstgjort substrat. Till exempel kan C5, som är komplementärt till intronens interna styrsekvenser, omvandlas till C4 + C6 och andra produkter (figur 3.3.12).

3D‑strukturen hos det vikta RNA är ansvarig för reaktionens specificitet och effektivitet (analogt med de allmänna ideerna om proteiner med enzymatisk aktivitet). Specificiteten av skarvning orsakas, åtminstone delvis, genom basparning mellan 3’‑änden av uppströms exon och en region i intron som kallas den interna styrsekvensen. Den initierande G nt binder också till en specifik plats i RNA nära 5′ – skarvplatsen. Således två platser i pre-rRNA intron används sekventiellt i skarvning (figur 3.3.13 A och 3.3.13.B.).

figur 3.3.13.A.

den interna styrsekvensen (igs) krävs inte för katalys men ger specificitet. Således kan man designa rna för exonutbyte i celler. Denna potentiella väg för terapi för genetiska störningar kallas ” exon replacement therapy.