Nucleosome Structure David Marcey 2020

I. Inledning
II. Histon Octamer
III. DNA Superhelix
IV. referenser
Directions

lämna kommentarer/förslag eller bekräfta användningen av denna webbplats genom att besöka vår feedback sida

denna utställning visar molekyler i den vänstra delen av skärmen och text som adresserar struktur-funktionsrelationer av molekylerna i den högra delen (nedan). Använd rullningslisten till höger för att bläddra igenom texten. Om du använder en annan webbläsare än Firefox (den rekommenderade webbläsaren för den här webbplatsen), var noga med att tillåta popup-fönster. I Chrome kan du klicka på popup-blockeringsikonen i den högra delen av adressfältet..
för att framkalla återgivningar av molekylen som illustrerar vissa punkter, klicka på radioknapparna:

klicka på load PDB-knapparna,, när de finns.

för att återställa molekylen, använd återställningsknapparna:

om du ändrar storlek på webbläsarfönstret uppdaterar du bara sidan för att återställa korrekt visning.

I. Inledning

nukleosomkärnpartikeln innehåller två kopior av varje histonprotein (H2A, H2B, H3 och H4) och 146 baspar (bp) av superheliskt DNA lindat runt denna histonoktamer. Det representerar den första ordningen av DNA-förpackning i kärnan och som sådan är den huvudsakliga strukturen som bestämmer DNA-tillgänglighet.

återgå till början

två kopior av varje histonprotein, H2A, H2B, H3 och H4, monteras i en oktamerisk skiva. Även om varje monomer har en N-terminal svans som projicerar från histonkärnan, visar strukturen till vänster Endast en enda svans från en H3-monomer.

alla fyra histonproteiner delar ett mycket liknande strukturellt motiv, histonvecket, bestående av tre alfa-helixer förbundna med två slingor (visas här för H2A):
alpha1-loop1-alpha2 – loop2-alpha3.

histonoktomeren består av fyra Histon heterodimerer: två vardera av H3-H4 och H2A-H2B.

histonveckmotiven för heterodimererna är ordnade med loop1 av en monomer nära intill loop2 av den andra monomeren, som visas här för en H3-H4 heterodimer. En symmetriaxel passerar mellan de två långa alfa2-spiralerna av de två monomererna.

H3-H4 heterodimererna parar sig för att bilda en tetramer genom interaktioner mellan en fyrhelixbunt (alfa2 och alfa3 av H3 från varje dimer). Föreningen av denna (H3-H4)2 tetramer med DNA är det första steget i nukleosomaggregat.

varje H2A-H2B heterodimer binder till (H3-H4)2 tetramer via en annan, homolog, fyrhelixbunt (alfa2 och alfa3 från både H2B och H4) och förenar H2B-och H4-histonvecken.

återgå till början

III. DNA Superhelix

146 bp av dubbel spiralformigt DNA lindas runt histonoktamer i en superhelix.

en tvåfaldig symmetriaxel faller mellan H3-H4-heterodimererna och H2A-H2B-heterodimererna.

denna symmetriaxel skär en enda bp i mitten av superhelixen och delar 146 bp-DNA i 72 bp och 73 bp-halvor definierade av den centrala bp.

vänsterhänt DNA superhelix sveper runt histonkärnan i 1,65 varv.