12.4: Self‑splicing do skupiny I intronů (pre‑rRNA Tetrahymena)

Intron je Katalyzátorem pro Splétání v tomto Systému

RNA zapojení do self‑splicing je stechiometrický, ale vyříznut intron má katalytickou aktivitu in vitro. Po sérii intramolekulární cyclization a štěpení reakce, lineární vyříznut intron chybí 19 nukleotidů (tzv. L-19 IVS), mohou být použity katalyticky přidat a odstranit nukleotidů na umělém substrátu. Například, C5, která je komplementární k vnitřní průvodce sekvence intron, může být převeden na C4 + C6 a jiné produkty (Obrázek 3.3.12).

Obrázek 3.3.12.

3‑D struktury složené RNA je zodpovědné pro specifičnost a účinnost reakce (analogicky k obecné představy o proteiny s enzymatickou aktivitou). Specifičnost sestřihu je způsobena, alespoň zčásti, párováním bází mezi 3 ‚ koncem upstreamového exonu a oblastí v intronu zvanou vnitřní vodicí sekvence. Iniciační G nt se také váže na konkrétní místo v RNA v blízkosti 5‘ místa spojení. Dvě místa v intronu před rRNA se tedy používají postupně při sestřihu (obrázek 3.3.13 A a 3.3.13.B.).

obrázek 3.3.13.A.

Obrázek 3.3.13.B. Katalytické doména skupiny i intron z Tetrahymena pre-rRNA, znázorněné v RNA sekundární struktury pohledu (levý panel) a v pohledu na terciární struktury (pravý panel).

vnitřní průvodce sekvence (IGS) není nutné pro katalýzu ale poskytuje specifičnost. Lze tedy navrhnout RNA pro výměnu exonů v buňkách. Tato potenciální cesta pro terapii genetických poruch se nazývá “ exon substituční terapie.

Obrázek 3.3.14



Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.