Ehrlichia

Ehrlichia genom obsahuje mnoho různých variant genů, které kódují vnější membránové proteiny, které prošly intenzivní změny po dlouhou dobu. Předpokládá se, že velká rozmanitost genů proteinů vnější membrány pochází z událostí duplikace genů, následované fúzí a štěpením výsledných paralogů genu. Tyto duplikace, fúze, a štěpné události tvoří více genových kopií a fragmentů, které jsou schopné hromadit mutace. Tyto kopie a fragmenty membránových proteinů se pak mohou rekombinovat procesem zvaným genová konverze, což vede k nové genové variantě. To má hluboký vliv na kondici organismu. Přežití Ehrlichie do značné míry závisí na imunitní odpovědi hostitele. S vyšším rozsahem vnějších membránových proteinů se parazit může účinněji vyhnout imunitnímu systému hostitele a vytvořit přetrvávající infekci.

nejvýraznějším důkazem evoluce ve velikosti genomu Erhlichie je přítomnost tandemových opakování, které se mezi jednotlivci a druhy velmi liší. V průběhu času mohou jednotlivci rozšiřovat nebo stahovat části svých genů a alel, což přidává genetickou variaci a někdy může ovlivnit fenotyp.

Ehrlichia a její blízce příbuzné rodu Anaplasma ukázat extrémní různorodost ve struktuře a obsahu jejich genomů. Tato rozmanitost je přímým důsledkem vzácné klony s extrémní genomy, které se objevily náhodou po opakované zúžení události, a tato rozmanitost přetrvává z důvodu nedostatku selektivní omezení rychlého růstu uvnitř hostitelské tkáně.

e. ruminantiumEdit

evoluční změny ve vnějších membránových proteinů vedly ke vzniku nových kmenů, které mohou infikovat větší škálu hostitelů. Infekční vodnatelnosti osrdečníku, způsobené E. ruminantium, je převládající klíšťová onemocnění hospodářských zvířat v Africe a Karibiku, ale také ohrožuje Americkou pevninu. Z tohoto druhu vznikly tři kmeny v důsledku evoluční změny v jejich genomech. Když sekvenace jejich genomů,e mnoho aktivních genomické změny, k nimž došlo, jako je vysoká substituce sazby, zkrácen geny, a přítomnost pseudogenes a tandemových repetic. Při analýze náhradních sazby mezi třemi kmeny v 888 orthologous kódování sekvence DNA, tři kódování sekvence DNA byly zaujatý vůči nonsynonymous substituce, které ovlivňují fenotyp. Naproti tomu 181 kódujících sekvencí DNA bylo předpojato k synonymním substitucím, které neovlivňují fenotyp. To naznačuje, že selekční tlak na udržení funkce proteinu existoval a tento výběr působil proti nesynonymním mutacím.

e. canisEdit

e. canis je malé, obligátně intracelulární, klíšťaty přenášené, gramnegativní α-proteobakterium. Tento druh je zodpovědný za globálně distribuovanou Psí monocytární ehrlichiózu. E. canis také ukazuje vývoj ve svých komplexních membránových strukturách a strategiích vyhýbání se imunitě. Tyto evoluční funkce jsou odvozeny vlastnosti, které se nezobrazí v předchozím linií, což může znamenat, že tyto vlastnosti mohou přispět k fitness výhodou, že držel této linie. Unikátní glykoproteiny a hlavní vnější membránové proteiny mohou být exprimovány různě pomocí 25 různých genů. Glykoproteiny jsou důležitými cíli imunitní odpovědi hostitele, připojení k hostitelské buňce a další rysy imunitní odpovědi. Čím více proteinových genů vnější membrány lze exprimovat, tím vyšší je šance, že se organismus vyhne rozpoznání imunitním systémem hostitele.

také reduktivní evoluce je přítomna v e. canis. Genom měl ve srovnání se svými předky těžkou ztrátu enzymů metabolické dráhy. Reduktivní vývoj u obligátních intracelulárních patogenů je obvykle přímým důsledkem genetického driftu v malých populacích, nízké míry rekombinace a vysoké míry mutace. Hostitel metabolické dráhy enzymy převzít kontrolu funkcí ztracených v důsledku reduktivní evoluce, a to přispívá k jeho potřebě hostitele. Přirozený výběr nemusí být důvodem malých genomů.



Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.