Genetické studie odpovědi, kde bylo kuře domácký, a jeho předka

Kuřata hrály podstatnou roli v lidských společnostech po celém světě a přesto geografické a časové původ jejich domestikace zůstává záhadou. Ve snaze řešit tento problém vědci analyzovali 863 genomů z celosvětového odběru vzorků kuřat a zástupců všech čtyř druhů volně žijících ptáků džungle a každého z pěti poddruhů ptáků červené džungle (RJF).

studie vedená Ming-Shan Wangem z Kunming Institute of Zoology Čínské akademie věd byla zveřejněna 24. června v Cell Research. To naznačuje, že domácí slepice byly původně odvozeny z RJF poddruh Gallus gallus spadiceus, jejichž současné rozložení je převážně v jihozápadní Číně, severní Thajsko a Myanmar.

po domestikaci byla kuřata přemístěna do jihovýchodní a jižní Asie, kde se místně kříží s poddruhy RJF a dalšími druhy ptáků džungle. Molekulární hodiny analýza naznačuje, že domácí kuřata lišily od G. g. spadiceus 9500 ± 3300 lety, když tento uzel nemusí nutně korelovat s počátkem domestikace proces, jako kuřata jsou archeologicky viditelné mnohem později.

domácí vesnice kuřat byly hybridizovány s wild G. g. spadiceus v Thajsku v polovině 20. století a divoké RJF spojky byly odstraněny z hnízda a vylíhl od domácích slepic.

Na vytvoření primární RJF poddruhů, z nichž domácí kuřata byly odvozeny a pochopit genetické mechanizmy kuřecí domestikace, je nutné analyzovat jaderné genomy obou předpokládá, divokých příbuzných a domácí populace, v rámci a nad rámec přirozené distribuce rozsahy všechny RJF poddruhů.

studie sekvenován 787 celé genomy: 627 domácí kuřata, 142 RJFs zastupující všech pět poddruhů, 12 zelené džungle ptáci, 2 šedé džungli drůbež a 4 Ceylon jungle slepice. Maximalizovat pravděpodobnost zachycení genetické variability mezi RJF poddruhů, zařazených do vzorku jednotlivců, které patří k sobě poddruh z nejméně tří geograficky vzdálených lokalitách a zajistit, aby alespoň jedna osoba z každé poddruh byl sekvenován, aby se alespoň 20× pokrytí.

Analýza hlavních komponent (PCA) také zdůrazňuje oddělení mezi poddruhy RJF. Je zajímavé, že některé G. g. murghi (distribuován po celé severní Indický subkontinent) a G. g. jabouillei (omezuje na Jižní Čína a Severní Vietnam) jedinců pohromadě.

analýzy ukazují, že všechny RJF poddruhy jsou geneticky diferencované, které obecně odpovídají jejich zeměpisné oblasti a taxonomické klasifikace. Z pěti RJF poddruh, jedinci G. g. spadiceus jsou nejvíce úzce souvisí s všechny domácí kuře populace

Tím, že kombinuje monophyletic povahu všech domácích kuřat, výsledky z těchto analýz společně naznačují, že kuřata byla pravděpodobně domestikován v Holocénu od G. g. spadiceus poddruh RJF.

„Naše výsledky v rozporu s předchozí tvrzení, že slepice byly domácké v Neolitu severní Číně a Indus Valley Civilizace (provádí na základě podezření, kuřecí ostatky nalezené na místě mohendžodaro v Pákistánu). Nicméně, PCA ukazuje, že G. g. murghi vzorky z nejzápadnější Severní Indii ukázal hlubší rozdílnost od kuřat, než zbývající ptáky. G. g. murghi nashromážděná od severovýchodní Indie,“ číst noviny.