Classification des acides aminés

très bien, passons en revue la classification des acides aminés et j’ai mis en évidence le mot classe dans la classification pour vous parce que je vais peindre pour vous une image d’une salle de classe qui est pleine de vingt acides aminés différents et imaginez simplement que c’est la classe la plus diversifiée que vous ayez jamais vue parce que chaque acide aminé a sa propre chaîne latérale unique et cela les rend distinctement différents de l’acide aminé à côté d’eux et tout comme une vraie salle de classe pleine d’enfants même si chaque acide aminé est unique et spécial à leur manière, vous pouvez commencer à voir que certains de ces acides aminés sont plus semblables qu’ils ne sont différents et nous pouvons commencer à voir ces similitudes dans les propriétés chimiques des chaînes latérales et cela nous permet de les regrouper en différentes catégories et ces propriétés chimiques incluent la charge de la chaîne latérale la capacité de la chaîne latérale à subir une liaison hydrogène et aussi si nous pouvons ou non classer cette chaîne latérale comme étant acide ou basique afin que les 20 acides aminés puissent être divisés en deux groupes principaux. le premier groupe comprend l’amino non polaire les acides aminés et ensuite le deuxième groupe comprend les acides polaires et les acides aminés non polaires peuvent également être considérés comme les acides aminés hydrophobes ou craignant l’eau et inversement, vous avez les acides polaires qui peuvent être considérés comme hydrophiles, ce qui signifie que l’eau aime et encore une autre façon dont j’aime penser à ces deux groupes principaux sont les acides aminés hydrophobes, ils sont un peu comme les ennemis de l’eau, ils ne veulent pas vraiment interagir avec l’eau du tout, ils interagissent simplement avec eux-mêmes alors que les acides aminés hydrophiles sont très ouverts et accueillants pour interagir avec l’eau et ils sont donc amateurs d’eau, puis dans les deux groupes d’acides aminés hydrophobes non polaires et hydrophiles polaires, vous avez ensuite une autre décomposition en sous-groupes et ces sous-groupes incluent les acides aminés qui ont des gènes côté alcool chaînes latérales aromatiques neutres acides ou basiques, alors regardons de plus près ces acides aminés qui ont des groupes alkyles comme chaînes latérales et comme vous pouvez le voir ici, nous avons sept acides aminés différents et je viens de dessiner la chaîne latérale pour vous, j’ai laissé le reste de la molécule juste pour tout adapter ici et nous avons la glycine alanine valine méthionine la leucine, l’isoleucine, le prolène et la proline sont l’exception, j’y ai dessiné tout l’acide aminé car, comme vous pouvez le voir, sa chaîne latérale forme cette structure annulaire intéressante avec le groupe amino dans l’épine dorsale de la molécule, donc je l’ai simplement inclus pour être complet, de sorte que toutes ces chaînes latérales sont constituées de groupes alkyles, à l’exception de la glycine, car sa chaîne latérale ne contient qu’un atome d’hydrogène, mais parce qu’elle se comporte de manière similaire à un groupe latéral de chaîne alkyle, elle obtient quelque chose dans cette catégorie d’acides aminés et chaque fois que vous voyez un acide aminé avec un groupe alkyle comme son. groupe latéral vous devriez penser que cet acide aminé est non polaire et donc ils vont aussi être hydrophobes maintenant regardons de plus près ces acides aminés qui ont des groupes aromatiques dans le cadre de leur chaîne latérale et rappelez-vous que nous sommes toujours sous l’égide d’acides aminés hydrophobes non polaires ici et j’ai donc dessiné pour vous ici deux acides aminés phénylalanine et tryptophane et à quoi devriez-vous penser lorsque vous regardez ces acides aminés, donc en plus de penser que ces acides aminés doivent sentir vraiment bon parce qu’ils s’appellent des acides aminés aromatiques, ce qui pourrait être vrai, mais vous devriez pensez également à la même chose que lorsque vous voyez des acides aminés avec des groupes alkyles comme chaînes latérales, ces acides aminés que vous voyez ici sont également non polaires et hydrophobes et cela a du sens parce que les chaînes aromatiques sont également constituées de carbones et d’hydrogène et vous n’aviez pas tort si vous pensiez que les composés aromatiques pourraient sentir vraiment bon parce que beaucoup de nos herbes et épices les plus aromatiques que nous connaissons tous, comme le basilic ou la cannelle et la vanille, sont composées des mêmes sortes de structures annulaires que nous voyons ici, maintenant que nous nous sommes attaqués au non polaire acides aminés hydrophobes plongeons dans les acides aminés polaires et hydrophiles le premier groupe que nous examinerons est le groupe neutre ici, nous avons la sérine / thréonine asparagine glutamine cystéine et la tyrosine la façon dont je me souviens que ce sont les acides aminés polaires, c’est que ces acides aminés ont une chaîne latérale qui contenait un atome d’oxygène ou de soufre qui a tendance à monopoliser tous les électrons autour d’eux pour créer une charge négative localisée sur cet atome et ensuite une charge positive sur le reste de la chaîne latérale afin que vous puissiez voir pourquoi ces acides aminés aiment traîner avec de l’eau maintenant depuis l’eau est également polaire de la même manière et ces acides aminés sont considérés comme neutres car, bien qu’ils soient suffisamment polaires pour interagir avec l’eau, ils ne sont pas assez polaires pour être considérés comme un acide ou une base, donc lequel des acides aminés hydrophiles polaires se qualifie bien comme acide, ce seraient ces deux acides aminés ici l’acide aspartique et l’acide glutamique, comme vous pouvez le voir, ces acides aminés ont un acide carboxylique dans le cadre de leur chaîne latérale qui est un donneur d’hydrogène fort très volontaire qui qualifie ces acides aminés comme acides lorsque ces chaînes latérales donnent leur hydrogène et ils sont laissés dans l’anion ensuite, dans ce cas, nous les appelons respectivement aspartate et glutamate, donc vous pourriez les voir mentionnés de cette manière, enfin et surtout, nous avons les acides aminés de base et ce sont l’histidine lysine et l’arginine et la façon dont je me souviens que ces acides aminés sont basiques, c’est que si vous regardez de plus près leurs chaînes latérales, vous voyez quelques atomes d’azote et rappelez-vous que l’azote est un accepteur de protons très disposé et c’est pourquoi ils sont considérés comme basiques