IMGT Aide-m xhammoire
töltés, hidrogén donor és akceptor atomok, és a polaritás az aminosav oldalláncok
- töltés az aminosav oldalláncok
- hidrogén donor és akceptor atomok az aminosav oldalláncok
- polaritás az aminosav oldalláncok
- polaritás az aminosav oldalláncok
töltés az aminosav oldalláncok
töltött oldalláncok láncok
az aminosav oldallánc töltése az AA PK-jától (1.táblázat) és az oldat pH-jától függ.
- negatív töltésű (savas oldalláncok): az aszparaginsav és a glutaminsav
a pK-nál magasabb pH-értéknél (2.táblázat) a karboxil-láncok elveszítik a H+ iont (protont), és negatív töltésűek. Ezért savak.
a pK-nál alacsonyabb pH-értéknél az aszparaginsav és a glutaminsav oldalláncok töltetlenek.
- pozitív töltésű (bázikus oldalláncok): lizin, arginin és hisztidin
a pK-nál magasabb pH-értéknél (2.táblázat) az amin oldalláncok töltetlenek.
a pK-nál alacsonyabb pH-nál a lizin, arginin és hisztidinezid láncok H+ iont (protont) fogadnak el, és pozitív töltésűek. Ezért alapvetőek.
1.táblázat: az aminosav oldallánc csoport pK-ja.Az oldallánc-csoport pK-ja az a pH, amelyen a karboxil-amin-csoport pontosan fele töltődik.
| aminosav | pK az oldallánc csoport |
|---|---|
| aszparaginsav | 3,9 |
| glutaminsav | 4,2 |
| lizin | 10,5 |
| arginin | 12,5 |
| hisztidin | 6.0 |
az arginin oldallánc nagyon alapvető, mert pozitív töltését rezonancia stabilizálja.
a hisztidin oldallánc két nitrogénje viszonylag gyenge affinitással rendelkezik a H+ – hoz, és semleges pH-n csak részben pozitív.
2.táblázat: az aminosav oldalláncok töltése.Csak az oldalláncok jelennek meg.
pH=7-nél az 5 aminosav oldalláncai töltődnek.
töltetlen oldalláncok
tizenöt AA töltetlen oldallánccal rendelkezik. Ezek a következők: A, N, C, Q, G, I, L, M, F, P, S, T, W, Y, V.
az aminosav oldalláncok Hidrogéndonor és akceptor atomjai
kattintson ide az aminosav-atomok nómenklatúrájához.
- 3 aminosav (arginin, lizin és triptofán) oldalláncában hidrogén-donor atomok vannak.
- 2 aminosav (aszparaginsav, glutaminsav) oldalláncában hidrogén akceptor atomok vannak.
- 6 aminosav (aszparagin, glutamin, hisztidin, szerin, treonin és tirozin) oldalláncában mind hidrogén donor -, mind akceptoratomok vannak.
3.táblázat: Hidrogéndonor és akceptor atomok aminosav oldalláncokban.
a zárójelek között, azon “sp-hidrogének” száma, amelyeket egy donor atom adományozhat, ha egynél több.
b zárójelek között, azon hidrogénkötések száma, amelyeket egy akceptor atom elfogadhat, ha egynél több.
- 9 aminosav (alanin, cisztein, glicin, izoleucin, leucin, metionin, fenilalanin, prolin, valin) oldalláncukban nincs hidrogén-donor vagy akceptor Atom.
az aminosav oldalláncok polaritása
A hidrogén donor és/vagy akceptor atomokkal rendelkező aminosav oldalláncok polárisak
A hidrogén donor és/vagy akceptor atomok nélküli aminosav oldalláncok nem polárisak
10 nem poláros aminosav van (beleértve a triptofánt, a hidrogén donor atom ellenére): a, C, G, I, L, M, F, P, V, W.
ezek a nem poláros aminosavak:
- hajlamosak csoportosítani oldalláncaikat a fehérjék belsejében.a
- gyakran vesz részt Van der Waals interakciókban.
a párosított cisztein lehetővé teszi a diszulfidkötéseket.