12.4: Auto‑splicing per introni di gruppo I (pre‑rRNA di Tetrahymena)

L’Introne è il catalizzatore per lo Splicing in questo sistema

Il coinvolgimento dell’RNA nell’auto-splicing è stechiometrico, ma l’introne asportato ha un’attività catalitica in vitro. Dopo una serie di reazioni di ciclizzazione e scissione intramolecolari, l’introne asportato lineare privo di 19 nucleotidi (chiamato L-19 IVS) può essere utilizzato cataliticamente per aggiungere e rimuovere nucleotidi ad un substrato artificiale. Ad esempio, C5, che è complementare alle sequenze guida interne dell’introne, può essere convertito in C4 + C6 e altri prodotti (Figura 3.3.12).

Figura 3.3.12.

La struttura 3‑D dell’RNA piegato è responsabile della specificità e dell’efficienza della reazione (analoga alle idee generali sulle proteine con attività enzimatica). La specificità dello splicing è causata, almeno in parte, dall’accoppiamento di base tra l’estremità 3′ dell’esone a monte e una regione nell’introne chiamata sequenza guida interna. Il G nt iniziante inoltre lega ad un sito specifico nel RNA vicino al 5 ‘ sito della giuntura. Pertanto due siti nell’introne pre-rRNA vengono utilizzati sequenzialmente nello splicing (Figura 3.3.13 A e 3.3.13.B.).

Figura 3.3.13.A.

Figura 3.3.13.B. Il dominio catalitico dell’introne del gruppo I da Tetrahymena pre-rRNA, mostrato nella vista della struttura secondaria dell’RNA (pannello di sinistra) e in una vista della struttura terziaria (pannello di destra).

La sequenza di guida interna (IGS) non è richiesta per la catalisi ma conferisce specificità. Così si può progettare RNA per lo scambio di esoni nelle cellule. Questo potenziale viale per la terapia per le malattie genetiche è chiamato ” terapia sostitutiva esone.

Figura 3.3.14



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