IMGT Aide-mémoire
di Carica, idrogeno donatore e accettore di atomi, e polarità delle catene laterali degli amminoacidi
- Carica delle catene laterali degli amminoacidi
- Idrogeno donatore e accettore di atomi di catene laterali degli amminoacidi
- la Polarità delle catene laterali degli amminoacidi
Carica delle catene laterali degli amminoacidi
Carica catene laterali
L’addebito sulla laterali degli amminoacidi a catena dipende dalla pK di AA (Tabella 1) e il pH della soluzione.
- Carica negativa (catene laterali acide): acido aspartico e acido glutammico
Ad un pH superiore al loro pK (Tabella 2), le catene carbossilicside perdono uno ion H+ (protone)e sono cariche negative. Sono quindi acidi.
Ad un pH inferiore al loro pK, le catene laterali dell’acido aspartico e dell’acido glutammico sono scaricate.
- Carica positiva (catene laterali di base): lisina, arginina e istidina
Ad un pH superiore al loro pK (Tabella 2), le catene laterali dell’ammina sono scaricate.
Ad un pH inferiore al loro pK, le catene di lisina, arginina e istidina accettano uno ion H+ (protone) e sono caricate positivamente. Sono quindi fondamentali.
Tabella 1: pK del gruppo catena laterale aminoacidica.Il pK del gruppo a catena laterale è il pH al quale viene caricata esattamente la metà di un gruppo carbossilico o amminico.
| Aminoacidi | pK della catena laterale di gruppo |
|---|---|
| acido Aspartico | 3.9 |
| acido Glutammico | 4.2 |
| Lisina | 10.5 |
| Arginina | 12.5 |
| Istidina | 6.0 |
La catena laterale dell’arginina è molto semplice perché la sua carica positiva è stabilizzata dalla risonanza.
I due atomi di azoto della catena laterale di istidina relativamente debole affinità per un H+e sono solo parzialmente positiva a pH neutro.
Tabella 2: Costo delle catene laterali degli amminoacidi.Vengono mostrate solo le catene laterali.
A pH=7, le catene laterali dei 5 aminoacidi sono cariche.
Catene laterali non caricate
Quindici AA hanno catene laterali non caricate. Sono: A, N, C, Q, G, I, L, M, F, P, S, T, W, Y, V.
Atomi donatori e accettori di idrogeno delle catene laterali degli amminoacidi
Clicca qui per la nomenclatura degli atomi di amminoacidi.
- 3 aminoacidi (arginina, lisina e triptofano) hanno atomi donatori di idrogeno nelle loro catene laterali.
- 2 aminoacidi (acido aspartico, acido glutammico) hanno atomi di accettore di idrogeno nella loro catena laterale.
- 6 aminoacidi (asparagina, glutammina, istidina, serina, treonina e tirosina) hanno entrambi atomi di idrogeno donorand accettore nelle loro catene laterali.
Tabella 3: Atomi di donatore e accettore di idrogeno nelle catene laterali degli amminoacidi.
a Tra parentesi, numero di “sp hydrogenens” che un atomo donatore può donare, se più di uno.
b Tra parentesi, numero di legami idrogeno che un atomo accettore può accettare, se più di uno.
- 9 aminoacidi (alanina, cisteina, glicina, isoleucina, leucina, metionina, fenilalanina, prolina, valina) non hanno atomi donatori o accettori di idrogeno nelle loro catene laterali.
Polarità delle catene laterali dell’amminoacido
Le catene laterali dell’amminoacido con gli atomi del donatore e/o dell’accettore dell’idrogeno sono polari
Le catene laterali dell’amminoacido senza donatore e/o atomi dell’accettore dell’idrogeno sono non polari
Ci sono 10 amminoacidi non polari (compreso il triptofano, nonostante
Questi aminoacidi non polari:
- tendono a raggruppare le loro catene laterali insieme all’interno delle proteine.
- sono spesso coinvolti nelle interazioni di Van der Waals.
Le cisteine accoppiate consentono legami disolfuro.