ゲノムブラウザとは何ですか、なぜ私たちはそれを必要とするのですか？

このステップでは、ゲノム全体の文脈で遺伝子を理解するのに役立つ画期的なツールであるゲノムブラウザを紹介します。

ゲノムブラウザは、ユーザーフレンドリーな方法でゲノムデータを表示するコンピュータプログラムです。 これは、全ゲノムFASTAファイルなど、一般的に非常に大きなファイルを取り、我々のユーザーがそこに情報の意味を理解できるようにそれらを表示します。 ほとんどの場合、ゲノムブラウザは、異なるタイプのデータファイルに表現される異なるタイプのデータを統合するように設計されています。 例えば、ゲノム内の遺伝子の位置に関する情報を含むアノテーションファイルは、ゲノムブラウザにロードすることもできるので、遺伝子の位置を視覚的に検査することができます。 これは、単離（すなわち単一の遺伝子配列）ではなく、ゲノムの文脈で情報を見ることができるときに、結果をより直感的に解釈できるため、重要です。

利用可能な多くのゲノムブラウザがあります。 彼らができることは、研究者やブラウザを利用するコミュニティが必要とするタスクに依存します。 それらの多くはインターネットから直接アクセスすることができ、一般的に検索または研究された生物からの情報を表示することができます。 例えば、ヒトゲノムプロジェクトの出現で、カリフォルニア大学サンタクルーズはUCSCゲノムブラウザを開発しました。 今日では、ヒトゲノムだけでなく、ワームやハエなどの他の多くの生物の情報を表示します。

このコースでは、細菌ゲノムで使用するために特別に設計されたゲノムブラウザを使用しようとしています。 その名前はArtemisであり、オンラインで使用するのではなく、コンピュータにインストールして”ローカル”に実行します。

しかし、アルテミスのダウンロードとインストールに進む前に、その作成とその主な機能について学びましょう。