IMGT Aide-mémoire
電荷、水素ドナーとアクセプター原子、およびアミノ酸側鎖の極性
- アミノ酸側鎖の電荷
- アミノ酸側鎖の水素ドナーとアクセプター原子
- アミノ酸側鎖の極性
アミノ酸側鎖の電荷
荷電側鎖
アミノ酸側鎖上の電荷は、aaのpk（表1）および溶液のphに依存する。負荷電（酸性側鎖）
- 負荷電（酸性側鎖）
- 負荷電（酸性側鎖）: アスパラギン酸とグルタミン酸
それらのpKよりも優れたpHで（表2）、カルボキシリキシド鎖はH+イオン（プロトン）を失い、負に帯電する。 したがって、それらは酸である。
それらのpKよりも劣るpHでは、アスパラギン酸とグルタミン酸側鎖は荷電していません。
- 正荷電（塩基性側鎖）：リジン、アルギニンおよびヒスチジン
それらのpK（表2）よりも優れたpHでは、アミン側鎖は荷電していない。
そのpKよりも低いpHでは、リジン、アルギニンおよびヒスチジネシド鎖はH+イオン（プロトン）を受け入れ、陽性荷電する。 したがって、それらは基本的なものです。表１：アミノ酸側鎖群のＰＫ。側鎖基のＰＫは、カルボキシリコールアミン基の正確に半分が荷電されるｐＨである。tr>
アミノ酸 側鎖群のpK アスパラギン酸 3.9 グルタミン酸 4.2 リジン 10.5 アルギニン 12.5 ヒスチジン 6。0 アルギニン側鎖は、その正電荷が共鳴によって安定化されるため、非常に基本的です。ヒスチジン側鎖の二つの窒素は、H+に対して比較的弱い親和性を有し、中性pHで部分的にのみ陽性である。
表2：アミノ酸側鎖の電荷。側鎖のみが示されている。
pH=7では、5つのアミノ酸の側鎖が荷電する。P>
非荷電側鎖
十五AAは非荷電側鎖を持っています。 それらは次のとおりです:A、N、C、Q、G、I、L、M、F、P、S、T、W、Y、V。
アミノ酸側鎖の水素供与体および受容体原子
アミノ酸原子の命名法はこちらをクリックしてください。
- 3アミノ酸（アルギニン、リジン、トリプトファン）は、それらの側鎖に水素ドナー原子を有する。
- 2アミノ酸（アスパラギン酸、グルタミン酸）は、その側鎖に水素受容体原子を有する。
- 6アミノ酸（アスパラギン、グルタミン、ヒスチジン、セリン、トレオニン、チロシン）は、それらの側鎖に水素ドノル原子と受容体原子の両方を有する。表３：アミノ酸側鎖中の水素供与体原子および受容体原子。
表３：アミノ酸側鎖中の水素供与体原子および受容体原子。
括弧の間に、ドナー原子が寄付できる”sp水素”の数、複数の場合。
括弧内のb、アクセプター原子が受け入れることができる水素結合の数、複数の場合。
- 9アミノ酸（アラニン、システイン、グリシン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、バリン）は、その側鎖に水素供与体または受容体原子を有さない。
アミノ酸側鎖の極性
水素供与体および/または受容体原子を有するアミノ酸側鎖は極性である
水素供与体および/または受
これらの非極性アミノ酸:
- は、タンパク質の内部に側鎖を一緒にクラスター化する傾向があります。
- は頻繁にファンデルワールス相互作用に従事しています。
対になったシステインはジスルフィド結合を可能にする。