RNA-Sequencing Vs.Microarrays

RNA-seqが可能にするものを考慮すると、遺伝子発現プロファイリングにおけるこの技術的なスイッチは驚くことではありません:

• 新規、無添加遺伝子の検出
• 配列レベルの変化（コード領域変異、遺伝子融合、a-to-I編集イベント）の検出
• 標準的なマイクロアレイとは異なり、代替スプライシングイベント、さらには新規のものの検出
• シーケンシングの深さを制御することによって調整可能なより広いダイナミックレンジ
• 非参照生物の発現プロファイリング（あまり簡単ではないが、できる！）などが挙げられる。

ほとんどの場合、サンプルの発現プロファイルを取得することは、RNAシークエンシングの代わりにマイクロアレイを使用して少し安くなります。 しかし、RNA-seqの利点は、追加コストを容易に上回る可能性があります。

これにもかかわらず、マイクロアレイは完全に消えていません。 私達は私達の顧客のためのマイクロアレイの表現データを規則的に分析します（RNA-seqほど多くではないが）。 表現測定を計画している研究者は、どの技術を使用するかについて私たちの意見を尋ねることがよくあります。ここでの本当の質問は次のとおりです。

: RNAシークエンシングの代わりにマイクロアレイを使用するのはいつ意味がありますか？

時には意味があります。 1)上記のパラメータのどれも重要ではない、および/または2)次のいずれかが適用される場合は、マイクロアレイに固執する正当な理由があるかもしれ:

• 実証済みの臨床的有用性を持つマイクロアレイベースの診断テストを使用しています。
• サンプルが多数あり、コストが重要です。
• 同じアレイあなたが考慮したいかもしれないバイオインフォマティクスの視点: あなたのチームにデータを使用してバイオインフォマティクスを学ぶ研究者がいる場合は、RNA-seqデータ分析が現代（そして未来）でより有用なスキルであ）マイクロアレイ分析よりもラボ。

  上記のリストは、RNA-seq対マイクロアレイの決定を下すのに役立つはずです。 しかし、それは常に最高のあなたの生物学的材料、研究の質問や予算に合ったプラットフォームを選択するために、bioinformaticianまたは測定プロバイダとの議論を持

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