12.4: Selvsplitning efter gruppe i‑introner (præ-rRNA af Tetrahymena)

Intronen er katalysatoren til splejsning i dette System

RNA-involvering i selvsplitning er støkiometrisk, men den udskårne intron har en katalytisk aktivitet in vitro. Efter en række intramolekylære cykliserings-og spaltningsreaktioner kan den lineære udskårne intron, der mangler 19 nukleotider (kaldet L-19 IVS), anvendes katalytisk til at tilføje og fjerne nukleotider til et kunstigt substrat. For eksempel kan C5, som supplerer intronens interne styringssekvenser, konverteres til C4 + C6 og andre produkter (figur 3.3.12).

figur 3.3.12.

3‑D-strukturen af det foldede RNA er ansvarlig for reaktionens specificitet og effektivitet (analogt med de generelle ideer om proteiner med ensymatisk aktivitet). Specificiteten af splejsning forårsages, i det mindste delvist, ved baseparring mellem 3’‑enden af opstrøms eksonen og et område i intronen kaldet den interne styringssekvens. Den initierende G nt binder også til et specifikt sted i RNA tæt på 5′ splejsningsstedet. Således anvendes to steder i præ-rRNA-intronen sekventielt til splejsning (figur 3.3.13 A og 3.3.13.B.).

figur 3.3.13.A.

figur 3.3.13.B. Det katalytiske domæne af gruppe i intron fra Tetrahymena pre-rRNA, vist i RNA sekundær struktur visning (venstre panel) og i en visning af den tertiære struktur (højre panel).

den interne styresekvens (IGS) er ikke påkrævet til katalyse, men giver specificitet. Således kan man designe RNA ‘ er til eksonudveksling i celler. Denne potentielle vej til terapi for genetiske lidelser kaldes “eksonudskiftningsterapi.

figur 3.3.14



Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.