Hvad er et genom, og hvorfor har vi brug for et?

i dette trin introducerer vi genomsøgere, som er revolutionerende værktøjer, der hjælper os med at forstå gener i sammenhæng med hele genomer.

et genomprogram er et computerprogram, der viser genomiske data på en brugervenlig måde. Det tager typisk meget store filer, såsom hele genom FASTA-filer og viser dem på en måde, som vi brugere kan give mening om oplysningerne der. I de fleste tilfælde er genomsøgere designet til at integrere forskellige typer data repræsenteret i forskellige typer datafiler. For eksempel kan annotationsfiler, dem, der indeholder information om placeringen af gener i genomet, også indlæses i en genom-bro.ser, så vi visuelt kan inspicere genernes placering. Dette er vigtigt, fordi vi kan fortolke resultater mere intuitivt, når vi kan se information i en genomisk sammenhæng og ikke isoleret (dvs.en enkelt gensekvens).

der er mange genomsøgere tilgængelige. Hvad de kan gøre afhænger af de opgaver, der er nødvendige af forskerne og det samfund, der gør brug af bro.sereren. Mange af dem kan tilgås direkte fra internettet, og de er i stand til at vise oplysninger fra almindeligt søgte eller undersøgte organismer. For eksempel, på fremkomsten af Human Genome Project, University of California Santa Crus udviklet UCSC genom bro.ser. I dag viser det information ikke kun for det menneskelige genom, men også for mange andre organismer som orme og fluer.

i dette kursus skal vi bruge en genom-bro.ser designet specielt til brug med bakterielle genomer. Dets navn er Artemis, og i stedet for at bruge det online, installerer vi det på vores computere og kører det “lokalt”.

men før vi fortsætter med at hente og installere Artemis, lad os lære om dens oprettelse og dens nøglefunktioner.