Nucleosom Structure David Marcey kart 2020
I. introduktion
II. Histonoktameren
III. DNA ‘ et Superheliks
IV. referencer
retninger
Efterlad kommentarer/forslag, eller bekræft venligst brugen af dette sted ved at besøge vores feedbackside
denne udstilling viser molekyler i venstre del af skærmen og tekst, der adresserer struktur-funktionsforhold mellem molekylerne i højre del (nedenfor). Brug rullebjælken til højre for at rulle gennem teksten. Hvis du bruger en anden bruger end
for at fremkalde gengivelser af molekylet, der illustrerer bestemte punkter, skal du klikke på radioknapperne:
klik venligst på Indlæs PDB-knapperne,, når de er til stede.
for at nulstille molekylet skal du bruge nulstillingsknapperne:
Hvis du ændrer størrelsen på dit bro.ser-vindue, skal du blot opdatere siden for at gendanne korrekt visning.
I. Introduktion
nukleosomkernepartiklen indeholder to kopier af hvert histonprotein (H2A, H2B, H3 og H4) og 146 basepar (bp) af superhelisk DNA viklet rundt om denne histonoktamer. Det repræsenterer den første rækkefølge af DNA-emballage i kernen og er som sådan den vigtigste struktur, der bestemmer DNA-tilgængelighed.
vend tilbage til begyndelsen
to kopier af hvert histonprotein, H2A, H2B, H3 og H4, samles i en octamerisk disk. Selvom hver monomer har en N-terminal hale, der rager ud fra histonkernen, viser strukturen til venstre kun en enkelt hale fra en H3-monomer.
alle fire histonproteiner deler et meget lignende strukturelt motiv, histonfolden, der omfatter tre alfa-helices forbundet med to sløjfer (vist her for H2A):
alpha1-loop1-alpha2 – loop2-alpha3.
histonoktomeren består af fire histon heterodimerer: to hver af H3-H4 og H2A-H2B.
histonfoldmotiverne for heterodimererne er arrangeret med loop1 af en monomer tæt sidestillet med loop2 af den anden monomer, vist her for en H3-H4 heterodimer. En symmetriakse passerer mellem de to lange alfa2-helices af de to monomerer.
H3-H4 heterodimerer parres for at danne en tetramer gennem interaktioner mellem et firespiralbundt (alpha2 og alpha3 af H3 fra hver dimer). Forbindelsen af denne (H3-H4)2 tetramer med DNA er det første trin i nukleosomsamling.
hver H2A-H2B heterodimer binder til (H3-H4)2 tetramer via en anden, homolog, fire-spiralbundt (alpha2 og alpha3 fra både H2B og H4), der forbinder H2B-og H4-histonfoldene.
vend tilbage til begyndelsen
III. DNA-Superheliksen
146 bp af dobbelt spiralformet DNA er viklet rundt om histonoktameren i en superhelik.
en dobbelt symmetriakse falder mellem H3-H4 heterodimerer og H2A-H2B heterodimerer.
denne symmetriakse skærer en enkelt bp i midten af superheliksen og deler 146 BP DNA i 72 bp og 73 bp halvdele defineret af den centrale bp.
den venstrehåndede DNA superheliks ombrydes omkring histonkernen i 1,65 omdrejninger.