Clasificación de aminoácidos

muy bien, repasemos la clasificación de aminoácidos y he destacado la palabra clase dentro de clasificación para ti porque voy a pintarte una imagen de un aula que está llena de veinte aminoácidos diferentes y simplemente imagínate que esta es la clase más diversa que hayas visto nunca porque cada aminoácido tiene su propia cadena lateral única y esto los hace claramente diferentes del aminoácido que está junto a ellos y al igual que un aula real llena de niños, a pesar de que cada aminoácido es único y especial a su manera, puede comenzar a ver que algunos de estos aminoácidos son más parecidos que diferentes y podemos comenzar a ver estas similitudes en las propiedades químicas de las cadenas laterales y esto nos permite agruparlos en varias categorías y esas propiedades químicas incluyen la carga de la cadena lateral, la capacidad de la cadena lateral para someterse a enlaces de hidrógeno y también si podemos clasificar o no esa cadena lateral como ácida o básica, por lo que los 20 aminoácidos se pueden dividir ampliamente en dos grupos principales, el primer grupo incluye los aminoácidos no polares los ácidos y luego el segundo grupo incluye los polares y los aminoácidos no polares también se pueden considerar como los aminoácidos hidrofóbicos o que temen al agua y, por el contrario, tienen los polares, que se pueden considerar hidrofílicos, lo que significa amor al agua, y otra forma en que me gusta pensar en estos dos grupos principales son los aminoácidos hidrofóbicos, son como los que odian el agua, en realidad no quieren interactuar con el agua, sino que simplemente interactúan consigo mismos, mientras que los aminoácidos hidrofílicos son muy abiertos y bienvenidos a interactuar con el agua, los amantes del agua y luego dentro de los dos grupos de aminoácidos hidrofóbicos no polares e hidrofílicos polares, luego tienen una división adicional en subgrupos y esos subgrupos incluyen esos aminoácidos que tienen genes laterales alcohólicos, cadenas laterales aromáticas, neutros, ácidos o básicos, así que echemos un vistazo más de cerca a los aminoácidos que tienen grupos alquilos como cadenas laterales y como pueden ver aquí tenemos siete aminoácidos diferentes y acabo de dibujar la cadena lateral para ustedes, he dejado el resto de la molécula para encajar todo aquí y tenemos glicina alanina valina metionina leucina isoleucina y proleno y prolina es la excepción, he dibujado todo el aminoácido allí porque, como pueden ver, su cadena lateral forma esta interesante estructura de anillo con el grupo amino en la columna vertebral de la molécula, así que lo incluí allí para completar, por lo que todas estas cadenas laterales están compuestas de grupos alquilos, con la única excepción de la glicina, porque su cadena lateral solo tiene un átomo de hidrógeno, pero porque se comporta de manera similar a un grupo lateral de cadena alquilo, obtiene algo a esta categoría de aminoácidos y cada vez que ves un aminoácido con un grupo alquilo como su grupo lateral deberías estar pensando que este aminoácido es no polar y, por lo tanto, también van a ser hidrofóbicos ahora, echemos un vistazo más de cerca a esos aminoácidos que tienen grupos aromáticos como parte de su cadena lateral y recuerda que todavía estamos bajo el paraguas de los aminoácidos hidrofóbicos no polares aquí, así que he dibujado para ti aquí dos aminoácidos fenilalanina y triptófano y qué deberías estar pensando cuando estás mirando estos aminoácidos, así que además de pensar que esos aminoácidos deben oler muy bien porque se llaman aminoácidos aromáticos, eso podría ser cierto, pero deberías también piensen lo mismo que cuando ven aminoácidos con grupos alquilos como sus cadenas laterales, estos aminoácidos que ven aquí también son no polares e hidrofóbicos y eso tiene sentido porque las cadenas aromáticas también están hechas de carbonos e hidrógeno y no se equivocaron si pensaron que los compuestos aromáticos podrían oler muy bien porque muchas de nuestras hierbas y especias más aromáticas con las que todos estamos familiarizados, como la albahaca o la canela y la vainilla, están compuestas de los mismos tipos de estructuras de anillos que vemos aquí, así que ahora que hemos abordado los no polares aminoácidos hidrofóbicos vamos a sumergirnos en los aminoácidos polares e hidrofílicos el primer grupo que veremos es el grupo neutro aquí tenemos serina/treonina asparagina glutamina cisteína y tirosina la forma en que recuerdo que estos son los aminoácidos polares es que estos aminoácidos tienen una cadena lateral que contiene un átomo de oxígeno o azufre que tiende a acaparar todos los electrones a su alrededor para crear una carga negativa localizada sobre ese átomo y luego una carga positiva sobre el resto de la cadena lateral para que fuera con agua ahora desde el agua también es polar de la misma manera y estos aminoácidos se consideran neutros porque aunque son lo suficientemente polares para interactuar con el agua, no son lo suficientemente polares para calificar como ácido o base, por lo que cuál de los aminoácidos hidrofílicos polares califica como ácido, que serían estos dos aminoácidos, el ácido aspártico y el ácido glutámico, como se puede ver, estos aminoácidos tienen un ácido carboxílico como parte de su cadena lateral, que es un donante de hidrógeno fuerte y muy dispuesto que califica a estos aminoácidos como ácidos cuando estas cadenas laterales donan su hidrógeno y quedan en aniones en ese caso, nos referimos a ellos como aspartato y glutamato, respectivamente, por lo que es posible que los vea referidos de esa manera, por último, pero no menos importante, tenemos los aminoácidos básicos y son la lisina de histidina y la arginina y la forma en que recuerdo que estos aminoácidos son básicos es que si miras más de cerca sus cadenas laterales, ves algunos átomos de nitrógeno y recuerdas que el nitrógeno es un aceptor de protones muy dispuesto y es por eso que califican como básico