IMGT Aide-mémoire
Átomos de carga, donante y aceptor de hidrógeno, y polaridad de las cadenas laterales de aminoácidos
- Carga de las cadenas laterales de aminoácidos
- Átomos donante y aceptor de hidrógeno de las cadenas laterales de aminoácidos
- Polaridad de las cadenas laterales de aminoácidos
Carga de las cadenas laterales de aminoácidos
Lado cargado cadenas
La carga en la cadena lateral de aminoácidos depende del pK del AA (Tabla 1) y del pH de la solución.
- Carga negativa (cadenas laterales ácidas): ácido aspártico y ácido glutámico
A un pH superior a su pK (Tabla 2), las cadenas carboxílicas laterales pierden un ion H+ (protón) y están cargadas negativamente. Por lo tanto, son ácidos.
A un pH inferior a su pK, las cadenas laterales de ácido aspártico y ácido glutámico no están cargadas.
- Carga positiva (cadenas laterales básicas): lisina, arginina e histidina
A un pH superior a su pK (Tabla 2), las cadenas laterales de amina no están cargadas.
A un pH inferior a su pK, las cadenas de lisina, arginina e histidina aceptan un ion H+ (protón) y están cargadas positivamente. Por lo tanto, son básicos.
Tabla 1: pK del grupo de cadenas laterales de aminoácidos.El pK del grupo de cadenas laterales es el pH al que se carga exactamente la mitad de un grupo de aminas carboxilicoras.
| Aminoácidos | pK de la cadena lateral de grupo |
|---|---|
| ácido Aspártico | 3.9 |
| ácido Glutámico | 4.2 |
| Lisina | 10.5 |
| Arginina | 12.5 |
| Histidina | 6.0 |
La cadena lateral de arginina es muy básica porque su carga positiva se estabiliza por resonancia.
Los dos nitrógenos de la cadena lateral de histidina tienen una afinidad relativamente débil por un H+y solo son parcialmente positivos a pH neutro.
Tabla 2: Carga de las cadenas laterales de aminoácidos.Solo se muestran las cadenas laterales.
A pH=7, las cadenas laterales de los 5 aminoácidos están cargadas.
Descargada cadenas laterales
Quince AA han descargado cadenas laterales. Son: A, N, C, Q, G, I, L, M, F, P, S, T, W, Y, V.
Átomos donantes y aceptores de hidrógeno de las cadenas laterales de aminoácidos
Haga clic aquí para la nomenclatura de los átomos de aminoácidos.
- 3 aminoácidos (arginina, lisina y triptófano) tienen átomos donantes de hidrógeno en sus cadenas laterales.
- 2 aminoácidos (ácido aspártico, ácido glutámico) tienen átomos aceptores de hidrógeno en su cadena lateral.
- 6 aminoácidos (asparagina, glutamina, histidina, serina, treonina y tirosina) tienen átomos donantes y receptores de hidrógeno en sus cadenas laterales.
Tabla 3: Átomos donantes y aceptores de hidrógeno en cadenas laterales de aminoácidos.
a Entre paréntesis, número de «hidrógenos sp» que un átomo donante puede donar, si es más de uno.
b Entre paréntesis, número de enlaces de hidrógeno que un átomo aceptador puede aceptar, si es más de uno.
- 9 aminoácidos (alanina, cisteína, glicina, isoleucina, leucina, metionina, fenilalanina, prolina, valina) no tienen átomos donantes o aceptores de hidrógeno en sus cadenas laterales.
Polaridad de las cadenas laterales de aminoácidos
Las cadenas laterales de aminoácidos con átomos donantes y/o receptores de hidrógeno son polares
Las cadenas laterales de aminoácidos sin átomos donantes y/o receptores de hidrógeno son no polares
Hay 10 aminoácidos no polares (incluido el triptófano, a pesar de un átomo donante de hidrógeno): A, C, G, I, L, M, F, P, V, W.
Estos aminoácidos no polares:
- tienden a agrupar sus cadenas laterales en el interior de las proteínas.
- participan con frecuencia en las interacciones de Van der Waals.
Las cisteínas emparejadas permiten enlaces de disulfuro.