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En medio de este trabajo innovador, Turing fue descubierto muerto en su cama, envenenado por cianuro. The official verdict was suicide, but no motive was established at the 1954 inquest. Su muerte a menudo se atribuye al «tratamiento» hormonal que recibió a manos de las autoridades, después de su juicio por ser gay. Sin embargo, murió más de un año después de que las dosis hormonales hubieran terminado; y, en cualquier caso, el resistente Turing había soportado este trato cruel con lo que su amigo cercano Peter Hilton llamó «fortaleza divertida». El veredicto de suicidio está ahora seriamente cuestionado. A juzgar por los registros de la investigación, no se presentó ninguna prueba que indicara que Turing tenía la intención de quitarse la vida, ni que el equilibrio de su mente estuviera perturbado (como afirmó el forense). De hecho, su estado mental parece no haber sido notable en ese momento. Aunque no se puede descartar el suicidio, también es posible que la muerte de Turing fuera simplemente un accidente, el resultado de inhalar vapores de cianuro de un experimento en el pequeño laboratorio contiguo a su dormitorio. Tampoco se puede descartar por completo el asesinato por parte de los servicios secretos, dado que Turing sabía tanto sobre el criptoanálisis aliado en un momento en que los homosexuales eran considerados una amenaza para la seguridad nacional.
Para el siglo XXI, el procesamiento de Turing por ser gay se había vuelto infame. En 2009, el entonces Primer ministro Gordon Brown, hablando en nombre del gobierno británico, se disculpó públicamente por el trato «totalmente injusto» de Turing. Cuatro años más tarde, la Reina Isabel II concedió a Turing un indulto real.
Turing fue un genio con visión de futuro y su investigación tuvo una amplitud notable, abarcando las matemáticas y los fundamentos de las matemáticas, la lógica matemática, el criptoanálisis, el diseño informático, los métodos mecánicos en matemáticas, la naturaleza de la inteligencia y la mente, y los mecanismos del crecimiento biológico. Su trabajo está unido por un tema general: su investigación sobre (como lo expresó Max Newman) «el alcance y las limitaciones de las explicaciones mecanicistas».