ATP szintáz (fof1-komplex): Részletes információ az enzimről
ATP szintáz GYIK
az ATP szintázzal kapcsolatos Gyakran Ismételt Kérdések (GYIK) listája azzal a feltételezéssel íródott, hogy az olvasó rendelkezik némi háttérismerettel a biokémia, az enzimológia és a fizikai kémia területén.
ez nem egy áttekintő cikk vagy valami hasonló; nincsenek utalások vagy kreditek, és nincs részletes leírás az egyes információk felhasználásával kapcsolatos kísérletekről. Ha érdekel gettinginto részletek, csak írj egy e-mailt (feniouk atpsynthase.info) és örömmel megvitatom az alábbi kérdéseket.
ajánlott olvasmány adunk egyes szakaszok alatt ““-jel.
Tartalomjegyzék
helyes név
az ATP szintáz fiziológiai szerepe
Az F-, A-, V-, P-és E-Atpázok közötti különbségek
az ATP szintáz architektúrája és alegysége
a reakció katalizált
az ATP szintézis/hidrolízis Termodinamikája
az ATP szintáz által katalizált ATP szintézis hajtóereje.
rotációs katalízis
az ATP-szintáz inhibitorai
az FO inhibitorai
Az F1 inhibitorai
Proton/ATP Arány
az ATP-szintáz helye
hány katalitikus hely van az enzimnek?
milyen gyors az ATP szintáz?
Proton transzlokáció keresztül fo
Mi a béta DELSEED szekvencia?
kaphatok választ az itt fel nem sorolt kérdésre?
helyes név
az IUBMBEnzyme nómenklatúra szerint az enzimet”ATP foszfohidroláznak (H+-transzporter)” nevezik. Az”ATP-szintáz” név azonban jobban tükrözi az enzim elsődleges funkciójátés manapság a legszélesebb körben elterjedt.
a másik név,amelyet a múltban gyakran használtak, a “H+-ATPase”, néha pontosabb “FOF1 H+-ATPase”. Sok más felfedezése utánaz ATP-vezérelt protonpumpák típusai ezeket a régi neveket kevésbé használják.
a többi nevet, hogy használták ATP szintáz a következők:
F1-ATPáz
FOF1-ATPáz
F-típusú ATPáz vagy egyszerűen F-ATPáz
H+-szállító ATPáz
mitokondriális ATPáz
kapcsolási tényezők (F0, F1és CF1)
kloroplaszt ATPáz
bakteriális Ca2+/Mg2+ATPáz
ATP szintáz komplex
komplex V (öt)
az ATP szintáz fiziológiai szerepe
hosszú történet rövidítése érdekében az ATP szintáz elsődleges funkciója a legtöbb organizmusban az ATP szintézis. Ezért a név. Bizonyos esetekben azonban a fordított reakció, azaz transzmembrán protonpumpálásaz ATP hidrolízis által táplált energia fontosabb. Tipikus példa: az anaerob baktériumok ATP-t termelnek erjedés, az ATP-szintáz pedig ATP – t használ az ionszállításhoz és a flagella mozgékonyságához szükséges protonmotoros erő előállításához.
sok baktérium élhet mind az erjedésből, mind a légzésből vagy a fotoszintézisből. Ebben az esetben az ATP szintetikusmindkét módon működik.
fontos kérdés az ATP-szintáz ATP-vezérelt protonpumpáló aktivitásának szabályozása annak érdekében, hogy elkerüljük a pazarló ATP-hidrolízist olyan körülmények között, amikor nem keletkezhet protonmotoros erő (pl. szivárgássérült membrán, leválasztó jelenléte stb.). Ebben az esetben az ATP hidrolízis problémává válik,mert gyorsan képes exchaust az intecelluláris ATP medence. A helyzet elkerülése érdekében minden ATP-szintáz olyan szabályozó mechanizmusokkal van felszerelve, amelyek elnyomják az Atpázistaktivitást, ha nincs protonmotoros erő. Az ATP hidrolízis gátlásának mértékea szervezettől függ. Növényekben (kloroplasztokban), ahol meg kell őrizniatp medence egész éjszaka, a gátlás nagyon erős: az enzim alig rendelkezik ATPáz aktivitással. Ezzel szemben az anaerob baktériumokban, ahol az ATP Szinház a főa protonmotoros erő generátora, az ilyen gátlás nagyon gyenge. A mitokondriális ATP szintáz valahol vanközött.
az F-, A-, V-, P-és E-Atpázok közötti különbségek
- az”F-típusú ATPáz” csak egy másik neve az ATP-szintáznak; az “F”betű a “foszforilációs Faktorból”származik.Az F-Atpázok baktériumokban, mitokondriumokban és kloroplasztokban vannak jelen. Fő funkciójuk a legtöbb esetben az ATP szintézis a transzmembránelektrokémiai protonpotenciál különbség rovására. Egyes baktériumokban azonban az enzim elsődleges funkciója megfordul: az ATP-t thidrolizálja, hogy létrehozza ezt a potenciális különbséget. Az In vitro F típusú Atpázok képeseka kísérleti körülményektől függően mindkét irányban működnek.
néhány Na+-bakteriális F-típusú ATPáz is megtalálható. - A-típusú Atpázokat találtak Archaea, funkciójuk hasonló az F-típusú ATP-szintázéhoz, de szerkezetileg nagyon hasonlóak a V-típusú Atpázokhoz (lásd alább).
- V-típusú H+-Atpázokat kezdetben eukarióta vacuolákban találtak. Elsődleges funkciójuk az ATP-vezérelt proton (vagy Na+) szivattyúzás a vacuol belső megsavanyításához.
- P-típusú Atpázok (néha E1-E2 Atpázoknak nevezik) különböző ionokat pumpálnak a membránba, és megtalálhatók a baktériumokban és a manyeukarióta sejtszervecskékben.
- E-típusú Atpázok (ne keverjük össze az E1-E2 Atpázokkal!) az ExtracellularATP hidrolizáló enzimcsaládja (lásd HerbertZimmermann Ecto-ATPase weboldalát a részletekért)
az F-, A-és V-típusú Atpázok multiszubunit komplexek, hasonlóak az overallarchitektúra szempontjából, és valószínűleg ugyanazzal a mag katalitikus mechanizmussal rendelkeznek. Ezekpár transzmembrán proton (vagy Na+ egyes F-Atpázokban) transzport,amelyet az enzim többi részéhez képest komplex alegységek elforgatásával érnek el Atfidrolízissel (vagy szintézis A – és F-Atpázokban).
a közös jellemzők számukra: “gomba” alakú, alfa – 3 béta-3 típusú hexamerichydrophil katalitikus domén, benne Gamma alegységgel. Az ezen enzimek által végzett katalitikus hatás nem tartalmaz foszforilált enzimetköztes.
ezeknek az enzimeknek a protontranszlokáló része egy gyűrű alakú alegységből áll oligomer (C-alegység az F-típusú Atpázok esetén); mindegyik alegység kritikusan fontos karboxilcsoportot visel, körülbelül a második transzmembranehelix közepén. Ez a karboxilcsoport közvetlenül részt veszproton transzlokáció.
A P-típusú Atpázok egészen más család ofion-transzlokáló ATP-vezérelt szivattyúk. Legtöbbjük szintén multiszubunitmembrán fehérjék; egy nagy f mind Athidrolízist, mind ionszivattyúzást végez. Sok különböző alcsalád vanp típusú Atpázok, általában az általuk szállított ion szerint osztályozva. H+, Na+, K+, Mg2+, Ca2+, Ag + andAg2+, Zn2+, Co2+, Pb2+, Ni2+, Cd2+, Cu+ és Cu2+ pumpáló p-ATPáz leírása.
az ATP hidrolízis során egy P-ATP-Vela katalitikus ciklus egy bizonyos szakaszában a foszfát átkerülaz enzim egyik Asp-maradéka. There is no evidence (neitherstructural nor functional) for rotary catalysis in P-type ATPases.Typical examples of such enzymes are yeast plasma membrane H+ATPase, K+/Na+ membraneATPase, Ca2+ membraneATPase.
1) Pedersen, P. L., andCarafoli, E. (1987) Ion motive ATPases. I. Ubiquity, properties, andsignificance to cell function. Trends Biochem. Sci. 4:146-150. 2) P-típusú ATPaseDatabase (Kristian B. Alexsen, Svájci bioinformatikai Intézet) 3 ) Kawasaki-Nishi S, Nishi T, Forgac M. (2003) Proton transzlokáció, amelyet ATP hidrolízissel hajtanak végre V-Atpázokban. FEBS Lett. 545(1): 76-85. 4) Perzov N, Padler-Karavani V, Nelson H, Nelson N. (2001) jellemzői ofV-Atpázok, amelyek megkülönböztetik őket az F-Atpázoktól. FEBS Lett. 504(3): 223-8. |
az ATP szintáz architektúrája és alegysége
az ATP szintáz egy nagy gomba alakú aszimmetrikus fehérje komplex. Aegyszerű bakteriális enzim (lásd az alábbi rajzot) 8 alegységtípusból áll, amelyek közül 5 képezi a katalitikus hidrofil F1-részt (a gomba “sapkáját”). Ezeket az alegységeket görög betűkkel (alfa,béta, Gamma, Delta és epszilon) nevezik el molekulasúlyuknak megfelelően. A proton transzlokáló fo rész 3 A, b és c típusú alegységből áll.
az ATP szintáz (F1) katalitikus része az ATP szintáz (F1) katalitikus részét képezi byalpha 3beta 3 hexamer, benne Gamma alegységgel és epszilonnal a gammához rögzítve. A Delta alegység a B alegység “tetejéhez” van kötve.a B alegység hidrofób transzmembrán szegmense érintkezik az a alegységgel.A katalitikus domén Gamma és Epsilon alegységei a c-alegységek tering alakú oligomerjeihez kötődnek.A Proton transzlokáció az A és c alegységek felületén történik.
az alegységek sztöchiometriája:
F1 | FO | ||
Alpha | 3 | a | 1 |
Beta | 3 | b | 2 |
Gamma | 1 | c | 10-15(?) |
Delta | 1 | ||
Epsilon | 1 |
Chloroplast ATP synthase and the enzyme from some photosyntheticbacteriahave 2 different, although similar, b-typesubunits in the protontranslocating FO portion, nevezetesen b és b’, mindegyik egy példánya.
magas homológia található a legtöbb ATP-szintáz alegységnélkülönbözőbaktériumok és kloroplasztok.
a mitokondriális enzim sokkal összetettebb; jelenleg 17 különböző típusú alegységet írnak le. Ezen alegységek némelyikének magas a homológiája a bakteriális és a kloroplaszt megfelelőivel, különösen az alfa, béta és Gamma alegységekkel az F1 részben, valamint az A és c alegységekkel a Foportusban. Számos alegység egyedülálló a mitokondriális enzim számára(lásd az alegység nómenklatúra táblázata részleteket).Az enzim katalitikus és proton transzlokáló “magja” azonban még mindig erősen homologikus a bakteriális és kloroplaszt ATP-Szintázéval. Az enzim általános topológiája szintén meglehetősen hasonló.
a reakció katalizált
ATP szintáz katalizálja ATP szintézis/hidrolízis kapcsolt totranszmembrán proton transfer.In szintézis esetén az energiabevitel a protonikus fluxustól a transzmembránelektrokémiai protonpotenciál különbségen keresztül érkezik ().Hidrolízis esetén az enzim ATP-vezérelt protonpumpaként működik, és keletkezik.
a katalizált reakció egyenlete
ADP3- + Pi2- + nH+P <> ATP4- + H2O+ (n-1)H+N ( pH > 7.2 )
A “P” és “N” indexek a csatlakozó membrán pozitív és negatív töltésű oldalát jelölik.
a pH érték fontos: a Pi2- + H+<> Pi – pK értéke 7,2, míg az ADP-ben és az ATP-ben a foszfát megfelelő pK-értéke közel 6,9.
ez azt jelenti, hogy a pH-intervallum 6,9 – 7,2 a prevailingreaction nem tartalmazza csapdába protonok:
ADP3 – + Pi – + nH+P <> ATP4- + H2O+ nh+n ( ph 6,9-7,2 )
a pH = 6,9 alatt azonban az uralkodó reakciót ismét protontrapping kíséri:
ADP2- + Pi- + nH+P <> ATP3- + H2O+ (n-1)H+N ( pH < 6.9 )
Thermodynamics of the ATP synthesis/hydrolysis
Traditionally the thermodynamics of ATP synthesis/hydrolysis isdescribed for the hydrolysis reaction:
ATP4- + H2O <> ADP3- + Pi2- + H+ ( pH > 7.2 )
“Physical Chemistry”(P.W.Atkins, 2. kiadás) -30 kJ mol-1 (-7,16 kcal/mol) értéket ad 37ocas “biológiai” standard Gibbsfree energia változás (o) errereakció. Ez egy ésszerű becslés, a -28-tól -36 kJmol-1-ig terjedő számokmegtalálható az irodalomban, a legnépszerűbb -30,6 kJ mol-1(-7,3 kcal/mol).
a standard Gibbsfree energiaváltozás,o, az a teljes energiamennyiség, amelyet vagy felhasználnak, vagy felszabadítanak egy vegyi reakció során standard körülmények között, amikor az összes reagens kémiai aktivitása egyenlő 1-gyel. Vizes oldatok reakciói esetén a tevékenységeket általában koncentrációk (azaz 1 M) helyettesítik; maga a víz aktivitása 1. A “biológiai” standard Gibbsfree energiaváltozás, o, hasonló paraméter, de a pH 7-nél van meghatározva, azaz a H+koncentrációja nem 1 M, hanem 10-7M. praktikusabb és kényelmesebb,mivel a legtöbb biológiai reakció fiziológiai pH-n zajlik.
nagyon fontos, és néha figyelmen kívül hagyott pont, hogy o nem a rendelkezésre álló energia mennyisége, hogy más, endoterm reakciókat hajtson végre a sejtben, mert a cellában lévő Feltételek nem szabványosak(lásd a fenti meghatározást). A tényleges Gibbs energiaváltozás
o’+ 2,3 RT log,
ahol a CADP,CPi, CH+és CATP a megfelelő reagensek tényleges koncentrációja,R a moláris gázállandó(8,314 J mol-1K-1), ést a Kelvinekben mért hőmérséklet. Hogy ezt a pontot világossá tegyük, vegyük figyelembe a következő példát aazok a határtalan értékek, amelyek közel állnak a valódi intracelluláris koncentrációkhoz:
CATP | 2 x 10-3 M-1 |
CADP | 2 x 10-4 M-1 |
CPi | 10-2 M-1 |
CH+ | 5 x 10-8 M-1(pHapprox. 7.3) |
A Gibbs energia változás ilyen körülmények között (hőmérséklet 310oK,vagy 37oc) lesz
o’+ 2,3 rt log ( cadpcpi Ch+ / catp )= -30 – 19,6 = – 49,6 kJ mol-1
ez a szám, amely a Hatáskomponensek tényleges koncentrációjából számítódik ki, tükrözi az adott körülmények között ATP-hidrolízissel összekapcsolt bármely más folyamat hajtóerejeként rendelkezésre álló energiát.
ebből következik, hogy ugyanaz a 49.6 kJ mol-1-et kell biztosítania proton transzport a membránon keresztül az elektrokémiai gradiensen keresztül, hogy ilyen magas ATP/ADP arányt tartson fenn. Ha feltételezzük, hogy minden egyes szintetizált ATP-molekulára 3 protont szállítunk, akkor az atranszmembrán H + elektrokémiai gradiens 49,6 / 3= 16,5 kJ mol-1(azaz 171 mV protonmotivorce) szükséges.
a fenti példa következtetése:
az ATP hidrolízis által biztosított energia nincs rögzítve (valamint aaz ATP szintetizálásához szükséges energia). Az első közelítés az ADP, ATP, Pi és a pH koncentrációjától függ. ez az energia logaritmikusan növekszik az INTP és a Pi koncentráció csökkenése, valamint az ATP vagy a H+ koncentráció növekedése esetén (= lineárisan csökken a pH növekedésével). Az alábbi grafikonok szemléltetik ezt a pontot,bemutatva a változását az egyik reagens (x tengely) koncentrációjának változásakor, feltételezve, hogy a többi reagens koncentrációját a fenti példában használt konstans értékek tartják (piros pontok jelzik a ebben a példában kiszámítva).
ennek a szakasznak a bezárásához szeretném megjegyezni, hogy bár az itt leírt ATP szintézis termodinamikája meglehetősen bonyolultnak tűnhet, valójában sokkal összetettebb. Az egyik itt elhanyagolt pont a különböző ADP és ATP protonációs állapotok voltak (lásd fent), a másik az, hogy az ATP-szintáz által katalizált reakcióban a tényleges szubsztrátok nem tiszta nukleotidok, hanem azok magnéziumkomplexei. Mivel azonban a magnéziumkoncentráció az élő sejtbenviszonylag magas, a pH általában 7 felett van.2, so the descriptiongiven is still applicable for thermodynamic estimates.
1) Nicholls, D. G. and S.J. Ferguson. Bioenergetics 2,London:Academic Press, 1992. 2) Any edition of “Physical Chemistry”by P. Atkins |
Driving force for ATP synthesis catalyzed by ATP synthase.
az ATP szintáz által katalizált ATP szintézist a transzmembrán elektrokémiai protonpotenciál különbsége táplálja, két összetevőből áll: a kémiai és az elektromos. Minél több proton van a membrán egyik oldalán relatíva másik, annál nagyobb a hajtóereje annak, hogy egy proton áthaladjon amembrán. Mivel a proton egy töltött részecske, mozgása isaz elektromos mező befolyásolja: a transzmembrán elektromos potenciáljaa különbség a protonokat a pozitív töltésű oldalról a negatív töltésű felé hajtja.
a vízimalom jó analógia: a gát előtti és utáni vízszint közötti különbség potenciális energiát biztosít; a lejtőn lévő víz áramlik a keréken; a forgatást valamilyen munka elvégzésére használják (ATP szintézis a mi esetünkben).
mennyiségileg értékét Joule-ban mólonként (J mol-1) mérjük, és a következőképpen definiáljuk:
= -F + 2.3 RT (pHP – pHN),
ahol a “P” és az “n” indexek a csatlakozó membrán pozitív és negatív töltésű oldalát jelölik; F a Faraday-állandó(96 485 C MOL-1); r a moláris gázállandó(8,314 j mol-1k-1),t a hőmérséklet kelvinekben, és a transzmembrán elektromos potenciálkülönbsége involts. A értéke megmondja, mennyi energiára van szükség (vagy felszabadul, a transzmembrán proton áramlásának irányától függően) 1 mol proton mozgatásához a membránon.
gyakran kényelmesebb használni nem , de protonmotív erő (PMF):
pmf = – /F = -2.3RT/F (pHP – pHN)
szobahőmérsékleten (25oC) a protonmotív erő (inmillivolts, valamint )a következő:
pmf = – 59 (PHP – PHN)
transzmembrán pH-különbség hiányában a PMF megegyezik a transzmembránelektromos Potenciálkülönbséggel,és közvetlenül mérhető számos kísérleti technikával (azaz permeátioneloszlás, potenciálérzékeny festékek, elektrokróm karotinoid sávváltás stb.).A transzmembrán pH-gradiens minden pH-egysége 59 mVof pmf-nek felel meg.
a legtöbb ATP szintézisben részt vevő biológiai membrán esetében a pmf érték 120 és 200 mV között van ( 11,6 és 19,3 kJ mol-1 között).
1) Nicholls, D. G. és S. J. Ferguson. Bioenergetika 2, London: Academic Press, 1992. 2) előadás aelektrokémiai potenciál Prof. A. R. Crofts 3) Cramer, W. A. és D. B. Knaff. Energiaátadás a biológiai membránokban: a bioenergetika tankönyve, Springer-VerlagNew York/Berlin/London |
rotációs katalízis
a katalitikus mechanizmus az ATP szintáz valószínűleg magában foglalja a gamma alegység forgását az alegységgel Együttszilon és C-alegység az enzim többi részéhez viszonyítva. Az ilyen rotációt kísérletileg kimutatták a protontranszlokációval nem összekapcsolt ATP-hidrolízis esetében. Sőt, a legújabb kísérletek azt mutatták, hogy ha a Gammasubunitot mechanikusan kényszerítik forgatásra, akkor ATP szintézis zajlik még proton-transzlokáló fo-rész nélkül is.
valószínűnek tűnik, hogy az ilyen rotáció in vivo történik. Azonban nincsközvetlen kísérleti bizonyíték az ilyen forgó mechanizmusra az intaktenzimben fiziológiai körülmények között.
a javasolt mechanizmus a következő:
- a protonmotivoreforce által vezérelve a protonok az enzim FO részén keresztül kerülnek átvitelre. Ez az átvitel hajtja a C-alegységoligomer gyűrű forgását az A és b alegységekhez képest (lásd itt a részleteket).
- a forgatás a C-alegységhez kötött Gamma és Epsilon alegységekbe kerül. Az aszimmetrikus Gamma alegység mechanikus forgatásakonformációs változásokat okoz az alfa 3 béta 3-hexamerben. A Gamma alegység minden 120 fokos forgatásaaz alfa-béta interfészen elhelyezkedő 3 katalitikus hely egyikét anopenált konformációvá kényszeríti. Frissen szintetizált ATP molekula szabadul fel, és helyette foszfát és ADP kötődik. A nyitott sitetofoszfát nagy affinitása rontja az ATP újracsiszolását és elősegíti az ADP kötődését.
- a forgás tovább megy, a Gamma alegység további 120 fokban fordul elő, a következő helyet a nyitott konformációba kényszerítve, és az ADP és az előző nyitott helyhez kötött foszfát elzáródik, és ATP-szintézis történik. A képződött ATP molekula felszabadul, amikor a gamma alegység egy 360 fokos fordulatot tesz, és ismét megnyitja a helyet.
1) W. Junge, H. Lill, andS. Engelbrecht. (1997) ATP synthase:anelectrochemical transducer with rotatory mechanics. Trends Biochem.Sci. 22(11):420-423, . 2) H. Wang and G. Oster. (1998) Energytransduction in the F1 motor of ATP synthase. Nature 396 (6708):279-282. 3) Weber, J., and Senior, A. E. (2003) ATPsynthesis driven by proton transport in F1FO-ATPsynthase. FEBS Lett. 545(1): 61-70. 4) szép filmek a http://nature.berkeley.edu/~hongwang/Project/ATP_synthase/ |
az ATP szintáz inhibitorai
az ATP szintáz aktivitása kifejezetten gátolja számos vegyület(mind szerves, mind szervetlen). Ezeknek az inhibitoroknak a többsége nagyon mérgező, ezért nagy óvatosságés a megfelelő biztonsági óvintézkedések elengedhetetlenek a velük való munka során (ez nem túl meglepőszerencsétlenné válunk, ha az ATP-szintázunk blokkolva van!).A legtöbb inhibitor specifikus vagy proton-transzlokáló FO-részre, vagy hidrofilf1-részre, így az alábbi szakasz ennek megfelelően oszlik meg.
az FO inhibitorai
Oligomicin
az Oligomicin az inhibitor, amely az “FO” nevet adta az ATP szintáz membránba ágyazott részének. Az “O” index betű FO-ban(nem nulla!) ennek a hidrofóbnak az Oligomicin érzékenységéből származikfoszforilációs faktor a mitokondriumokban.
Az Oligomicin az a alegység és a C gyűrűs oligomer felületén kötődik, és blokkolja a rotációs proton transzlokációt FO-ban. Ha az enzim jól kapcsolódik, az F1 aktivitásaszintén blokkolva van. Ez utóbbi jelenség miatt a mitokondriális F1-részegységamely összeköti az F1-et az FO-val Oligomicin-érzékenységet biztosító fehérje (OSCP).Ez az alegység elengedhetetlen az F1 és az FO közötti jó kapcsoláshoz, és az F1 ATPáz aktivitását érzékenyvé teszi az FO inhibitor oligomicinre, innen ered a neve.
Az Oligomicin specifikus a mitokondriális ATP-szintázra és mikromoláris koncentrációbanhatékonyan blokkolja a proton transzportot az FO-n keresztül. Ez az inhibitor egyes bakteriális enzimekben is működik, amelyek magasakhasonlóság a mitokondriális ATP-szintázhoz, pl. lila baktériumból származó enzim Rhodobacter capsulatus. De a kloroplasztokból és a legtöbb baktériumból származó ATP-szintáz (beleértve az Escherichia coli-t is)alacsony érzékenységgel rendelkezik az oligomicinnel szemben.
azt is meg kell jegyezni, hogy az oligomicin nagy koncentrációban is befolyásolja a mitokondriális F1 aktivitását.
DCCD
DCCD (abbreviation for Dicyclohexylcarbodiimide; also known as DCC, as N,N’-dicyclohexylcarbodiimide, as Bis(cyclohexyl)carbodiimide, and as 1,3-dicyclohexylcarbodiimide) is a small organic molecule thatcan covalently modify protonated carboxyl groups. Ha 8 feletti pH-n adják az ATP-szintázhoz, a DCCD szinte kizárólag a C alegység konzervált savas aminosav-maradékának karboxilcsoportjával reagál (ezért a c alegységet néha “DCCD-kötő fehérjének”nevezik). a karboxilcsoport egyetlen c-alegységben történő módosítása elegendő ahhoz, hogy az egész c-gyűrűs oligomer inaktív legyen. Mivel a DCCD kovalensen kötődik a c-alegységhez, ez a gátlás visszafordíthatatlan.
A C-alegység konzervált aminosavmaradékának karboxilcsoportja jelen van az összes eddig ismert ATP-szintázban. Tehát a DCCD egy univerzális inhibitor, amely képes működni a bakteriális, mitokondriális és kloroplaszt enzimekben. Ezenkívül a V-és a-típusú protont szállító ATP-k szintén érzékenyek a DCCD-re ugyanezen okból. A nátriumot szállító ATP-szintázokat a DCCD is hatékonyan gátolja.
alacsonyabb pH (1 és inaktiválja. Tehát ez a vegyület képesmind az FO, mind az F1 inhibitorának kell tekinteni. A foi-k gátlása azonban nagyon specifikus, jól definiált, és sokkal alacsonyabb DCCD-koncentrációt igényel, ezért általában ezt a gátlót használják fo-specifikusként.