Klassifisering av aminosyrer

ok, så la oss gå gjennom klassifiseringen av aminosyrer og jeg har fremhevet ordet klasse innen klassifisering for deg fordi jeg skal male for deg et bilde av et klasserom som er fullt av tjue forskjellige aminosyrer og bare bilde dette er det mest varierte klasserommet du noensinne har sett fordi hver aminosyre har sin egen unike sidekjede og dette gjør dem tydelig forskjellig fra aminosyren ved siden av dem og akkurat som et ekte klasserom fullt av barn, selv om hver aminosyre er unik og spesielt på sin egen måte kan du begynne å se at noen av disse aminosyrene er mer like enn de er forskjellige, og vi kan begynne å se disse likhetene i de kjemiske egenskapene til sidekjedene, og dette tillater oss å gruppere dem sammen i ulike kategorier, og de kjemiske egenskapene inkluderer ladningen av sidekjeden. de kan betraktes som hydrofile som betyr vannelskende og enda en måte som jeg liker å tenke på disse to hovedgruppene er de hydrofobe aminosyrene de er slags som vannhaterne de egentlig ikke vil samhandle med vann i det hele tatt, de samhandler bare med seg selv mens de hydrofile aminosyrene er veldig åpne og innbydende for å samhandle med vann og så er de vann elskere og deretter innenfor de to gruppene av ikke-polare hydrofobe og polare hydrofile aminosyrer du da har en ytterligere bryte ned i undergrupper og disse undergruppene inkluderer de aminosyrer som har alkohol side gener aromatiske side kjeder nøytrale de sure seg eller grunnleggende seg så la oss ta en nærmere titt på de aminosyrer som har alkylgrupper som sidekjeder og som du kan se her har vi syv forskjellige aminosyrer og jeg har nettopp trukket ut sidekjeden for deg jeg har forlatt resten av molekylet ut bare for å passe alt inn her og vi har glysin alanin valin metionin leucin isoleucin og prolene og prolin er unntaket jeg har trukket ut hele aminosyren der fordi som du kan se det er sidekjede danner denne interessante ringstrukturen med aminogruppen i ryggraden i molekylet, så jeg bare inkluderte den der for fullstendighet, slik at alle disse sidekjedene består av alkylgrupper med det ene unntaket er glycin fordi sidekjeden bare har et hydrogenatom i det, men fordi det oppfører seg på samme måte som en alkylkjede sidegruppe, blir det noe til denne kategorien aminosyrer og når du ser en aminosyre med en alkylgruppe som sin nå la oss ta en nærmere titt på disse aminosyrene som har aromatiske grupper som en del av deres sidekjede og husk at vi fortsatt er under paraplyen av ikke-polare hydrofobe aminosyrer her og så har jeg trukket ut for deg her to aminosyrer fenylalanin og tryptofan og hva skal du tenke når du ser på disse aminosyrene, så i tillegg til å tenke oh, må disse aminosyrene lukte veldig bra fordi de kalles aromatiske aminosyrer godt det kan være sant, men du bør disse aminosyrene som du ser her, er også ikke-polare og hydrofobe, og den slags gir mening fordi aromatiske kjeder også bare består av karboner og hydrogen, og du var ikke feil hvis du trodde at aromatiske forbindelser kan lukte veldig bra fordi mange av våre mest aromatiske urter og krydder som vi alle er kjent med som basilikum eller kanel og vanilje, består av de samme slags ringstrukturer som vi ser her, ok, så nå har vi taklet den ikke-polare hydrofobe aminosyrer la oss dykke inn i de polare og hydrofile aminosyrene den første gruppen som vi vil se på er den nøytrale gruppen her har vi serin/treonin asparagin glutamin cystein og tyrosin slik at jeg husker at disse er de polare aminosyrene, er at disse aminosyrene har en sidekjede som inneholdt et oksygen-eller svovelatom som har en tendens til å hog alle elektronene rundt dem for å skape en lokalisert negativ ladning over det atomet og deretter en positiv ladning over resten av sidekjeden, slik at du kan se hvorfor disse aminosyrene liker å henge med vann nå siden vann er også polar på samme måte, og disse aminosyrene anses som nøytrale fordi selv om de er polare nok til å interagere med vann, er de ikke sterkt polare nok til å kvalifisere som en syre eller base, så hvilken av de polare hydrofile aminosyrene kvalifiserer som sur vel det ville være disse to aminosyrene her asparaginsyre og glutaminsyre som du kan se disse aminosyrene har en karboksylsyre som en del av deres sidekjede som er en veldig villig sterk hydrogendonor som kvalifiserer disse aminosyrene som sure når disse sidekjedene donerer hydrogenet og de er igjen i anion. aspartat og glutamat henholdsvis slik at du kan se dem referert til på den måten sist men ikke minst har vi de grunnleggende aminosyrene, og de er histidin lysin og arginin, og måten jeg husker at disse aminosyrene er grunnleggende, er at hvis du ser nærmere på deres sidekjeder, ser du noen nitrogenatomer og husk at nitrogen er en veldig villig protonacceptor, og det er derfor de kvalifiserer som grunnleggende