Nukleosomstruktur David Marcey © 2020
I. Innledning
II. Histone Octamer
III. DNA Superhelix
IV. Referanser
Retninger
legg igjen kommentarer/forslag eller vennligst bekreft bruk av dette nettstedet ved å besøke vår tilbakemeldingsside
denne utstillingen viser molekyler i venstre del av skjermen, og tekst som adresserer struktur-funksjonsforhold mellom molekylene i høyre del (under). Bruk rullefeltet til høyre for å bla gjennom teksten. Hvis du bruker en annen nettleser Enn Firefox (den anbefalte nettleseren for dette nettstedet), må du sørge for å tillate popups. I Chrome kan du klikke på popup blocker-ikonet i høyre del av adressefeltet..
for å fremkalle gjengivelser av molekylet som illustrerer bestemte punkter, klikk på radioknappene:
Vennligst klikk på last PDB-knappene,, når de er til stede.
for å tilbakestille molekylet, bruk reset-knappene:
hvis du endrer størrelsen på nettleservinduet, oppdaterer du bare siden for å gjenopprette riktig visning.
I. Introduksjon
nukleosomkjernepartikkelen inneholder to kopier av hvert histonprotein (H2A, H2B, H3 Og H4) og 146 basepar (bp) av superhelisk DNA pakket rundt denne histonoktameren. Det representerer DEN første rekkefølgen AV DNA-emballasje i kjernen og som sådan er hovedstrukturen som bestemmer DNA tilgjengelighet.
tilbake til begynnelsen
To kopier AV hvert histonprotein, H2A, H2B, H3 og H4, settes sammen til en oktamerisk plate. Selv om hver monomer har En n-terminal hale som projiserer fra histonkjernen, viser strukturen til venstre bare en enkelt hale fra En H3-monomer.
Alle fire histonproteiner deler et svært likt strukturelt motiv, histonfoldet, som består av tre alfa-helikser forbundet med to løkker (vist her FOR H2A):
alpha1-loop1-alpha2-loop2 – alpha3. histonoktomeren består av fire histon heterodimerer: to Hver Av H3-H4 og H2A-H2B.histonfoldmotivene til heterodimerne er anordnet med loop1 av en monomer tett sidestilt med loop2 av den andre monomeren, vist her for En H3-H4 heterodimer. En symmetriakse passerer mellom de to lange alfa2-helikser av de to monomerer.
H3-H4 heterodimerer paret for å danne en tetramer gjennom interaksjoner av en fire-helix bunt (alpha2 og alpha3 Av H3 fra hver dimer). Foreningen av Denne (H3-H4)2 tetramer MED DNA er det første trinnet i nukleosommontering.
Hver h2a-H2B heterodimer binder seg til (H3-H4)2 tetramer via en annen, homolog, fire-helix bunt (alpha2 og alpha3 fra BÅDE H2B Og H4), sammenføyning av h2b og H4 histon folder.
tilbake til begynnelsen
III. DNA Superhelix
146 bp av dobbelt spiralformet DNA er pakket rundt histonoktameren i en superhelix. en todelt symmetriakse faller mellom H3-H4 heterodimerer og H2A-H2B heterodimerer.
denne symmetriaksen skjærer en enkelt bp i midten av superhelixen, og deler 146 bp DNA i 72 bp og 73 bp halvdeler definert av den sentrale bp.
den venstrehendte DNA superhelix brytes rundt histonkjernen i 1,65 omdreininger.