O que é um navegador do genoma e por que precisamos de um?

nesta etapa, introduzimos navegadores do genoma, que são ferramentas revolucionárias que nos ajudam a compreender genes no contexto de genomas inteiros.

um navegador do genoma é um programa de computador que exibe dados genômicos de uma maneira amigável. Ele pega tipicamente arquivos muito grandes, como arquivos FASTA genoma inteiro e exibe-os de uma forma que nós usuários podemos fazer sentido da informação lá. Na maioria dos casos, os navegadores do genoma são projetados para integrar diferentes tipos de dados representados em diferentes tipos de arquivos de dados. Por exemplo, arquivos de anotações, aqueles que contêm informações sobre a localização dos genes no genoma, também podem ser carregados em um navegador do genoma para que possamos visualmente inspecionar a localização dos genes. Isto é importante porque podemos interpretar os resultados mais intuitivamente quando podemos ver informação num contexto genômico e não isoladamente (isto é, uma sequência genética única).

existem muitos navegadores do genoma disponíveis. O que eles podem fazer depende das tarefas que são necessárias pelos pesquisadores e pela comunidade que faz uso do navegador. Muitos deles podem ser acessados diretamente da internet e eles são capazes de exibir informações de organismos comumente pesquisados ou pesquisados. Por exemplo, no advento do Projeto Genoma Humano, a Universidade da Califórnia Santa Cruz desenvolveu o navegador do genoma UCSC. Hoje em dia apresenta informação não só para o genoma humano, mas também para muitos outros organismos, como vermes e moscas.

neste curso vamos usar um navegador do genoma projetado especificamente para uso com genomas bacterianos. Seu nome é Artemis, e ao invés de usá-lo on-line, vamos instalá-lo em nossos computadores e executá-lo “localmente”.

mas antes de procedermos ao download e instalação de Artemis, vamos aprender sobre a sua criação e suas principais características.