avantajele și limitările tehnologiei microarray în cancerul uman
în luna aprilie a acestui an, am asistat la una dintre cele mai monumentale realizări în biologie: secvențierea completă a genomului uman. Decodarea și depunerea bazei de date a miliarde de baze de secvență este punctul de plecare al genomicii funcționale postsequence. Descoperirea tabelului Periodic a avut un impact important asupra chimiei. De asemenea, descifrarea completă a genomului uman va avea efecte impresionante asupra sănătății umane și a calității vieții. În prezent, înțelegem funcția unui număr limitat de gene umane. Studierea tuturor funcțiilor genelor umane este o provocare tehnologică. Pentru a face față acestei provocări, au fost dezvoltate noi instrumente de mare viteză. Testul microarray este o tehnologie moleculară puternică care permite studiul simultan al expresiei a mii de gene sau a produselor lor ARN, oferind o imagine exactă a expresiei genelor în celulă sau probă la momentul studiului.
de exemplu, expresia tuturor genelor pentru rezistența la medicamente și metabolism sau a tuturor oncogenelor cunoscute într-o celulă poate fi detectată și măsurată în același interval de timp (Brown și Botstein, 1999; Collins, 1999; Lander, 1999). Microarray-ul poate fi definit ca o colecție ordonată de microspoturi (sondele), fiecare punct conținând o singură specie de acid nucleic și reprezentând genele de interes. Această tehnologie se bazează pe hibridizarea între țintele libere etichetate derivate dintr-o probă biologică și o serie de multe sonde ADN care sunt imobilizate pe o matrice (Southern și colab., 1999). Țintele sunt produse prin transcriere inversă și etichetarea simultană a extractelor de ARN dintr-o probă biologică hibridizată cu sonde de fragment ADN. Semnalul de hibridizare produs pe fiecare sondă este nivelul de Expresie ARNm al genei corespunzătoare din probă la momentul studiului. Semnalele sunt detectate, cuantificate, integrate și normalizate cu software dedicat și reflectă ‘profilul expresiei genelor’ sau ‘portretul molecular’ pentru fiecare probă biologică.
multe mii sau zeci de mii de pete distincte pot fi imprimate pe un diapozitiv de siliciu sau sticlă sau pe o bază solidă din nailon. Există în principal două variante de microarrays: ADNc și microarrays oligonucleotidice (Schena și colab., 1995, 1996; Lockhart și colab., 1996). Deși ambele tipuri de microarray sunt utilizate pentru a analiza modelele de expresie a genelor, aceste variante sunt fundamental diferite (Lipshutz și colab., 1999). În microarrays ADNc, moleculele de ADN relativ lungi sunt imobilizate pe o suprafață solidă. Acest tip de microarray este utilizat mai ales pentru studii de screening și expresie la scară largă. Microarray-ul oligonucleotidic este fabricat prin sinteză chimică in situ direcționată spre lumină sau prin sinteză convențională urmată de imobilizare pe o matrice de sticlă. Acest microarray este utilizat pentru detectarea mutațiilor, cartografierea genelor și studii de expresie și permite detectarea diferențială a membrilor familiei genetice sau a transcrierilor alternative care nu se disting prin microarrays ADNc.
chimia microarray-ului în sine nu este nouă, deoarece tehnologia de hibridizare a fost bine stabilită de zeci de ani. Cu toate acestea, studiul simultan al mii de gene transformă tehnica microarray într-un instrument analitic puternic al întregului sistem. Au trecut aproape 10 ani de la crearea primelor microarrays și totuși această tehnologie se îmbunătățește și avansează. De la introducerea sa inițială, numărul de aplicații microarray s-a extins (Figura 1). Pornind de la utilizarea lor în screeningul genelor și identificarea țintelor, această tehnologie găsește noi aplicații, cum ar fi biologia dezvoltării, clasificarea bolilor, studiile de cale, descoperirea medicamentelor și toxicologia. Tehnologia implicată în producerea și utilizarea microarray-ului depășește domeniul de aplicare al acestei revizuiri, dar a fost revizuită pe larg în altă parte (Schena și colab., 1995; Niemeyer și Blohm, 1999; Bowtell, 1999; Brown și Botstein, 1999; Celis și colab., 2000; Cheung și colab., 1999; Duggan și colab., 1999; Graves, 1999; Khan și colab., 1999; Hegde și colab., 2000; Meldrum, 2000). Descriem aici câteva dintre evoluțiile recente și rezultatele tehnologiei microarray în cercetarea cancerului, discutăm problemele potențiale, descriem aplicațiile clinice și comentăm viitorul acestei tehnologii.
Numărul de citări găsite în MEDLINE prin introducerea „microarray” (bar gri) sau „microarray+cancer” (bar alb) pentru un PubMed căutare. Articolele au fost publicate între 1995 și 2002
importanța măsurării expresiei genelor globale în cancerele umane
caracterizarea populației de gene transcrise a dus la crearea unui nou termen, transcriptomul (Su și colab., 2002). Acest concept definește setul complet de gene transcrise exprimate ca ARN-uri mesager pentru o anumită specie. Prin urmare, transcriptomul reprezintă universul mesagerilor ARN care pot codifica proteinele. Doar aproximativ 5% din gene sunt active într-o anumită celulă la un moment dat. Majoritatea genelor sunt reprimate, iar acest control poate apărea fie la nivel transcripțional, fie la nivel translațional. Deoarece reglarea expresiei proteinelor la nivelul transcrierii este mai eficientă, majoritatea controlului are loc la acest nivel. Profilul expresiei genice a unei celule determină funcția, fenotipul și răspunsul la stimuli externi. Prin urmare, profilurile de expresie genetică pot ajuta la elucidarea funcțiilor celulare, a căilor biochimice și a mecanismelor de reglementare. În plus, profilurile de expresie genetică ale celulelor/țesuturilor bolii, comparativ cu controalele normale, pot promova înțelegerea patologiei bolii și pot identifica noi puncte terapeutice de intervenție, îmbunătățind diagnosticul și clarificând prognosticul.
în ultimii ani, au apărut mai multe metode de profilare a expresiei genelor și au fost aplicate cu succes cercetării cancerului. Acestea includ afișarea diferențială, analiza serială a expresiei genelor și microarrays (Velculescu și colab., 1995; Granjeaud și colab., 1999; Cheng și colab., 2002). Microarrays au devenit importante deoarece sunt mai ușor de utilizat, nu necesită secvențierea ADN-ului pe scară largă și permit cuantificarea paralelă a mii de gene din mai multe probe. Profilarea expresiei genetice a cancerelor reprezintă cea mai mare categorie de cercetare folosind tehnologia microarray și pare a fi cea mai cuprinzătoare abordare pentru a caracteriza cancerul molecular. Deși fenotipul cancerului este determinat doar parțial de transcriptomul său, acesta oferă încă o imagine clară a stării fiziologice a unei celule. Puterea acestei abordări a fost demonstrată în studii efectuate pe o mare varietate de afecțiuni maligne, inclusiv cancere ale sânului, capului și gâtului, ficatului, plămânului, ovarului, pancreasului, prostatei și stomacului (Bhattacharjee și colab., 2001; Dhanasekaran și colab., 2001; Garber și colab., 2001; Tonin și colab., 2001; al Moustafa și colab., 2002; Belbin și colab., 2002; Chen și colab., 2002; Han și colab., 2002; Hedenfalk și colab., 2002; Hippo și colab., 2002; Luo și colab., 2002a).
Mai multe studii de profilare a cancerului prin analiza microarray au folosit strategii diferite, cum ar fi tumora versus control, în care Profilul de expresie a genei tumorale este comparat cu proba de control corespunzătoare pentru a măsura diferențele și asemănările dintre ambele fenotipuri, stratificarea cancerului, în care profilurile de expresie a genei din diferite probe de același tip de cancer sunt comparate pentru a dezvălui subgrupuri distincte pentru a defini mai bine clasificarea moleculară a unui tip histologic comun de cancer și, în final, evaluarea temporală a tumorii, în care gena este comparată modelele de Expresie din probele tumorale derivate din diferite stadii de progresie sunt comparate pentru a elucida diferențele dintre stadiile timpurii și cele avansate ale bolii. Deși au fost publicate multe studii de analiză microarray în bolile umane, prezentăm aici unele dintre cele care au un interes clinic pentru oncologie.
microarray și cancerul de prostată
au fost publicate recent mai multe studii care utilizează microarrays pentru a caracteriza profilurile de expresie a genelor cancerului de prostată. Aceste studii au folosit tehnologia microarray ca instrument de descoperire a genelor pentru a identifica markerii genetici care discriminează între țesuturile normale și canceroase ale prostatei. Un studiu simplu de microarray a fost efectuat folosind matrice de membrane reperate pentru a analiza țesuturile și liniile celulare normale și canceroase (Bull și colab., 2001). Constatările microarray cu membrană sunt limitate de insensibilitatea relativă a acestei tehnici pentru a detecta transcrierile exprimate la niveluri scăzute și numărul mic de pete care pot fi plasate pe membrane; cu toate acestea, acest studiu a dat markeri candidați ai cancerului de prostată pentru o evaluare ulterioară. Cinci studii publicate au analizat profilurile de expresie a genelor în câteva mii de gene din țesuturile normale și de prostată și au folosit analiza ierarhică nesupravegheată pentru a sorta specimenele (Dhanasekaran și colab., 2001; Luo și colab., 2001, 2002b; Welsh și colab., 2001a; Singh și colab., 2002). Dhanasekaran și colab. (2001) au reușit să distingă prostata normală, hiperplazia benignă de prostată (BPH), cancerul de prostată localizat și probele de cancer de prostată metastatic folosind 9.984 microarrays cu puncte de element. Folosind analiza ierarhică de grupare, Luo și colab. (2001) au fost capabili să discrimineze 16 probe de cancer de prostată din nouă specimene BPH pe baza diferențelor în profilurile de expresie a genelor măsurate pe 6.500 de microarrays ADNc cu puncte de element. Welsh și colab. (2001a) a raportat o sortare similară a probelor de țesut prostatic normal și malign folosind microarrays oligonucleotidice. Interesant este că toate cele cinci grupuri au identificat hepsina serină protează transmembranară ca prezentând o expresie semnificativ crescută în țesuturile maligne în comparație cu cea a țesutului prostatic normal (Dhanasekaran și colab., 2001; Luo și colab., 2001, 2002b; Welsh și colab., 2001a; Singh și colab., 2002). Mulți alți markeri candidați ai cancerului de prostată, cum ar fi proto-oncogen PIM1, au apărut din alte studii și sunt investigați în continuare ca potențiali markeri de diagnostic. Expresia diminuată a PIM1 asupra imunohistochimiei probelor de tumori de prostată a conferit un risc crescut de recurență după operație (Dhanasekaran și colab., 2001). Alte grupuri care utilizează combinații de hibridizare subtractivă și analiză microarray au identificat mai mulți candidați potențiali pentru terapia imunomodulatoare a cancerului de prostată, inclusiv prostein (Xu și colab., 2001), STEAP (Hubert și colab., 1999) și p504S/Alfa-Metilacil-CoA-Racemază (Jiang și colab., 2001). Într-un studiu foarte recent, Virolle și colab. (2003) a folosit o linie celulară de cancer de prostată care exprimă un nivel constitutiv ridicat de proteină Egr1, un factor de transcripție supraexprimat în majoritatea celulelor tumorale agresive de cancer de prostată. Ei au evaluat reglarea transcripțională Egr1, prin efectuarea unei analize microarray oligonucleotidice folosind celule redate deficitare în Egr1 ca probă de comparație pentru identificarea genelor țintă Egr1. Pentru prima dată în țesuturile prostatei, acest studiu a confirmat rolul de creștere a Egr1 observat anterior în alte sisteme celulare și a identificat mai multe gene țintă noi care controlează în mod specific creșterea, progresia ciclului celular și căile apoptotice.
microarray și cancer oral
până în prezent, au fost publicate doar câteva studii microarray relevante pentru cancerul oral. Chang și colab. (1998) a ilustrat utilizarea microarrays ADNc pentru a caracteriza genele legate de transformare în cancerul oral. Villaret și colab. a folosit o combinație de scădere ADN complementară și analiză microarray pentru a evalua genele unice specifice pentru carcinomul cu celule scuamoase al capului și gâtului (HNSCC) ca potențiali markeri tumorali și candidați la vaccin. Nouă gene cunoscute s-au dovedit a fi semnificativ supraexprimate în HNSCC în comparație cu țesutul normal. În plus, patru gene noi au fost supraexprimate într-un subset de tumori (Villaret și colab., 2000). Alevizos și colab. (2001) a analizat transcriptomul în carcinomul cu celule scuamoase din cavitatea bucală. Ei au descoperit aproximativ 600 de gene candidate (oncogene, supresoare tumorale, factori de transcripție, markeri de diferențiere, proteine metastatice și enzime xenobiotice) care au fost exprimate diferențiat în cancerul oral, validând doar trei dintre aceste gene prin PCR.
Lu și colab. (2001) a folosit abordarea microarray pentru a evalua modificările profilului expresiei genelor în timpul inițierii și progresiei carcinomului cu celule scuamoase ale esofagului. Ei au examinat profilurile de expresie genetică în diferite stadii ale inițierii și progresiei cancerului esofagian pentru a identifica genele exprimate diferențiat între aceste etape. Frierson și colab. (2002) a folosit analiza microarray oligonucleotidică pentru a studia expresia a 8.920 de gene umane diferite în 15 carcinoame chistice adenoide (ACC), o linie celulară ACC și cinci glande salivare majore normale. Printre genele cu expresie modificată în ACC s-au numărat cele care codifică factorii de transcripție sox4 și AP-2 gamma, cazeină kinază 1 precum și epsilon și frizzled-7, ambii membri ai căii de semnalizare WNT/beta-catenină. Într-un studiu foarte recent, Leethanakul și colab. (2003) a generat biblioteci ADNc de înaltă complexitate din captarea cu laser a epiteliului scuamos normal și canceros microdisectat. În acest studiu, autorii au studiat informațiile de secvență disponibile folosind instrumente bioinformatice și au identificat 168 de gene noi exprimate diferențiat în epiteliul normal și malign. Mai mult, folosind matrice ADNc, au obținut dovezi că un subset al acestor noi gene ar putea fi foarte exprimat în HNSCC.
microarray și cancerul de sân
având în vedere eterogenitatea clinică a cancerului de sân, tehnologia microarray poate fi un instrument ideal pentru a stabili o clasificare mai precisă. Studiile inițiale care utilizează profilarea expresiei pe bază de microarray au demonstrat capacitatea sa de a clasifica corect cancerul de sân estrogen-receptor negativ și estrogen-receptor pozitiv (Perou și colab., 2000; West și colab., 2001) și pentru a diferenția tumorile legate de BRCA1 de tumorile legate de BRCA2 și sporadice (Hedenfalk și colab., 2001; van ‘ t Veer și colab., 2002).
studiul lui van ‘ t Veer și colab. a fost unul dintre cele mai extinse și informative studii efectuate până în prezent. Autorii au examinat 117 probe primare de sân prin profilarea expresiei genelor pe bază de microarray pentru a dezvolta profiluri prognostice și a le compara cu markerii prognostici cunoscuți în cancerul de sân. Din cele 5.000 de gene cu profiluri de Expresie variabile, 70 au fost identificate pentru o precizie optimă în prezicerea bolii recurente. Folosind această clasificare, autorii au prezis corect rezultatul real al bolii pentru 65 din cei 78 de pacienți. Cinci pacienți cu prognostic bun și opt pacienți cu prognostic slab au fost repartizați incorect. Markerii prognostici Standard în cancerul de sân au fost utilizați pentru a estima riscul de recurență a cancerului și pentru a ajuta la luarea deciziilor cu privire la terapia adjuvantă. Din păcate, markerii prognostici actuali nu identifică în mod adecvat cea mai corectă terapie pentru pacient. Puterea predictivă a abordării microarray este mult mai mare decât cea a abordărilor utilizate în prezent, dar trebuie validată în studii clinice mai prospective. Dacă valoarea prognostică a acestei abordări a fost confirmată, clasificatorul de profilare a expresiei ar avea ca rezultat o scădere de aproximativ patru ori la pacienții care primesc terapie adjuvantă inutil (Caldas și Aparicio, 2002).
Martin și colab. (2001) a descris o metodă de identificare a cancerului de sân circulant printr-un proces în două etape de afișare diferențială și profilare de Expresie bazată pe matrice de înaltă sensibilitate. Chiar dacă potențialul acestei tehnici este promițător, sensibilitatea și specificitatea acesteia trebuie încă îmbunătățite și este necesară mai multă muncă pentru a determina semnificația clinică a detectării profilului expresiei genelor în sângele periferic. Unele articole au demonstrat acum o legătură între profilurile de expresie a tumorii folosind tehnologia microarray și rezultatul clinic. De exemplu, Sorlie și colab. (2001) a demonstrat că subclasele tumorale definite prin profilarea expresiei pot prezice supraviețuirea fără boală și globală, iar Sotiriou și colab. (2002) a arătat că profilurile de Expresie pretratament au prezis răspunsul clinic la chimioterapie într-un eșantion mic de tumori de sân. Deși studiul lui Sorlie și colab. a fost foarte provocator, autorii nu au comparat valoarea prognostică a grupurilor identificate prin gruparea ierarhică cu factorii prognostici utilizați în prezent în cancerul de sân. Deoarece rezistența la medicamente în cancer este un obstacol major în calea chimioterapiei de succes, fezabilitatea obținerii unui profil molecular potențial sau a amprentei medicamentelor anticanceroase în celulele canceroase prin tehnologia microarray este esențială pentru a prezice răspunsul la chimioterapie. Kudoh și colab. (2000) a demonstrat această capacitate de a defini modificările profilurilor de expresie a genelor într-o linie celulară de cancer mamar tratată cu chimioterapie. Ei au monitorizat profilurile de Expresie ale celulelor cancerului de sân MCF-7 care au fost fie tratate tranzitoriu cu doxorubicină, fie selectate pentru rezistența la doxorubicină. Acest studiu a arătat că tratamentul tranzitoriu cu doxorubicină a modificat expresia unui grup divers de gene într-o manieră dependentă de timp.
microarray și cancerul ovarian
În ultimii ani, mai mulți cercetători au publicat studii interesante privind profilarea expresiei cancerelor ovariene. Martoglio și colab. (2000) au analizat profilurile de expresie genetică a cinci ovare normale și patru probe de adenocarcinom ovarian papilar seros slab diferențiate. Folosind un microarray de ADNc cu membrană internă din nailon, s-a constatat o creștere globală a markerilor legați de angiogeneză (de exemplu angiopoietina-1, VEGF), a markerilor apoptotici și neoplazici, a mediatorilor răspunsului imun și a markerilor potențiali noi ai cancerului ovarian (de exemplu cofilină, moesină și proteina factorului amortizor restrictiv de neuroni) în țesutul canceros. Studiul a fost interesant, deoarece au folosit o matrice de ADNc low-cost adaptate pentru studii de căi specifice, cum ar fi angiogeneza și tumorigenesis. Deoarece este problematică accesarea unei cantități adecvate de țesut tumoral ovarian timpuriu, cercetătorii au folosit diferite strategii pentru a eluda nevoia de cantități de țesut cerute de obicei prin analiza microarray. De exemplu, Ismail și colab. (2000) a raportat un studiu asupra a 864 de elemente ADN analizate împotriva a 10 linii de celule canceroase ovariene și a cinci linii celulare epiteliale normale folosind culturi celulare pe termen scurt pentru a extinde epiteliul de suprafață ovarian înainte de extracția ARN. Alți investigatori au purificat epiteliul ovarian prin proceduri in vitro, cum ar fi aderarea la sticlă sau îmbogățirea imunomagnetică (Ono și colab., 2000; Welsh și colab., 2001b). Cu toate acestea, aceste două abordări pot introduce prejudecăți în expresia genelor observate. De fapt, prima abordare (Ismail și colab., 2000) utilizează celule canceroase cultivate, care pot să nu reflecte cancerele in vivo din cauza posibilității unor modificări secundare ale expresiei genei care apar in vitro ca urmare a condițiilor de cultură. A doua strategie (Ono și colab., 2000; Welsh și colab., 2001b) este foarte lung și poate duce la degradarea mesagerilor ARN mai puțin stabili. Pentru a evita posibilele prejudecăți inerente culturilor in vitro utilizate în unele studii (Ismail și colab., 2000; Matei și colab., 2002), alți cercetători au studiat modelele de expresie a genelor direct din tumorile rezecate chirurgical (Shridhar și colab., 2001). Microarrays mici, specializate au mai multe avantaje practice și pot dezvălui informații care pot fi pierdute în microarrays mai mari. Sawiris și colab. (2002) a folosit un microarray ADNc foarte specializat numit ‘Ovachip’ și a găsit acest microarray extrem de sensibil la diferențierea cancerului ovarian de cancerul de colon pe baza modelelor de expresie a genelor. Biomarkerii de Screening pentru cancerul ovarian sunt foarte importanți din cauza stadiului tardiv al diagnosticului și a supraviețuirii slabe asociate cu acest tip de cancer. Recent, două studii au utilizat tehnologia microarray pentru a identifica doi markeri serici potențiali ai cancerului ovarian supraexprimați numiți osteopontin și prostasin și au raportat validarea preliminară a utilizării lor pentru detectarea precoce a bolii (Mok și colab., 2001; Kim și colab., 2002).
Microarray și alte tipuri de cancer
aplicarea tehnologiei microarray la alte tipuri de cancer uman se extinde rapid. Studiul de pionierat al lui Golub și colab. (1999) a demonstrat posibilitatea de a distinge leucemia mieloidă acută și leucemia limfoblastică acută (ALL) pe baza monitorizării expresiei genelor și a modului în care, într-o situație simulată ‘orbită’ de diagnosticul histologic, cele două clase ar fi putut fi descoperite doar prin modelele de Expresie genică. Alizadeh și colab. (2000) au identificat cele două forme de limfom difuz cu celule B mari (DLBCL) pe baza profilurilor de expresie genetică care indică diferite etape ale diferențierii celulelor B. Interesant este că această clasificare moleculară are o valoare prognostică independentă de stratificare prin clasificarea clinică obișnuită. Pentru a studia expresia genelor în malignitățile limfoide, un grup mare de colaborare a creat un microarray specializat, numit ‘Limfochip’, care este îmbogățit în gene care sunt exprimate selectiv în limfocite și în gene care reglează funcția limfocitelor (Alizadeh și colab., 1999). Acest grup a folosit acest microarray pentru a examina DLBCL și a găsit două forme moleculare diferite ale acestei tumori. Mai mult, ei au demonstrat că subgrupurile DLBCL au definit un subgrup de pacienți cu prognostic clinic distinct. Pentru a testa ipoteza că leucemia limfocitară cronică cu celule B (CLL) este mai mult de o boală, Rosenwald și colab. (2001) a legat modelele de Expresie genică ale LLC de starea lor mutațională Ig și de alte tipuri de celule B normale și maligne. Interesant este că genele identificate ca fiind foarte exprimate în LLC comparativ cu DLBCL au fost exprimate echivalent în toate probele de LLC, indiferent de starea lor mutațională Ig. Acest studiu a sugerat că toate cazurile de LLC au împărtășit un mecanism comun de transformare și/sau celulă de origine. Un studiu recent (Stratowa și colab., 2001) a propus o listă a potențialilor markeri prognostici noi implicați în traficul de limfocite și asociați cu stadializarea bolii și/sau supraviețuirea pacientului.
într-un studiu foarte recent, Gariboldi și colab. (2003) a analizat profilurile de expresie genetică din țesutul normal al șoarecilor susceptibili la tumori și rezistenți la piele pentru a identifica genele care joacă un rol funcțional în susceptibilitatea genetică. Acest studiu a sugerat un rol al genei Scca2, un membru al superfamiliei inhibitorului de serină protează, în predispoziția genetică la tumorile cutanate.
tehnologia Microarray a fost, de asemenea, utilizată în analiza melanomului (Bittner și colab., 2000). Acest studiu a sugerat că profilurile de expresie genetică din țesutul unui pacient individual pot fi conservate remarcabil în timp și că analiza transcrierii globale poate identifica subtipurile nerecunoscute ale melanomului cutanat și poate prezice caracteristicile fenotipice verificabile experimental.
studiile asupra celulelor și țesuturilor cancerului de colon au demonstrat suprimarea semnificativă a genei kinazei, WEE1Hu (Backert și colab., 1999).
multe Transcriptome se schimbă după o supraexprimare specifică a genelor legate de tumori. De exemplu, am utilizat un sistem de Expresie mediat de adenovirus al genei supresoare tumorale RB2/p130 într-o linie celulară de cancer pulmonar non-mic pentru a identifica gene specifice care sunt reglementate de pRb2/p130 (Russo și colab., 2003). Rezultatele noastre microarray au identificat o varietate de gene implicate în multe procese celulare, inclusiv diviziunea celulară, semnalizarea celulară/comunicarea celulară, structura/motilitatea celulară și expresia genelor și metabolismul. Aceste rezultate sugerează noi biomarkeri terapeutici potențiali în carcinomul pulmonar. Mai mult, rezultatele unui alt studiu microarray ADNc indică faptul că supraexprimarea genei supresoare tumorale PTEN poate inhiba invazia cancerului pulmonar prin reglarea în jos a unui grup de gene (Hong și colab., 2000). Având în vedere datele de mai sus, este clar că abordarea microarray este foarte importantă în analiza unei varietăți de tipuri de tumori.