Geenitutkimus vastaa, missä kana kesytettiin, ja sen esi-isällä

kanoilla on ollut merkittävä rooli ihmisyhteiskunnissa eri puolilla maailmaa, ja silti niiden domestikaation maantieteellinen ja ajallinen alkuperä on edelleen mysteeri. Pyrkiessään ratkaisemaan tämän ongelman tutkijat analysoivat 863 genomia maailmanlaajuisesta otoksesta, jossa oli kanoja ja edustajia kaikista neljästä luonnonvaraisesta viidakkokanalajista ja jokaisesta viidestä punaisen viidakon kanalinnun (RJF) alalajista.

Kiinan tiedeakatemian Kunming Institute of Zoology-tutkimuslaitoksen Ming-Shan Wangin johtama tutkimus julkaistiin Cell Research-lehdessä 24.kesäkuuta. Sen mukaan kotieläiminä pidetyt kanat olivat alun perin peräisin RJF: n alalajista Gallus gallus spadiceus, jonka nykyinen levinneisyys on pääasiassa Lounais-Kiinassa, Pohjois-Thaimaassa ja Myanmarissa.

kesyttämisen jälkeen kanoja siirrettiin muualle Kaakkois-ja Etelä-Aasiaan, jossa ne risteytyivät paikallisesti sekä RJF: n alalajien että muiden viidakkokanojen kanssa. Molekyylikelloanalyysi viittaa siihen, että kotieläiminä pidetyt kanat erkanivat G. g. spadiceuksesta 9500 ± 3300 vuotta sitten, vaikka tämä solmu ei välttämättä korreloi kesytymisprosessin alun kanssa, sillä kanat ovat arkeologisesti nähtävissä paljon myöhemmin.

kesykylän kanat risteytettiin villin G. G. spadiceuksen kanssa Thaimaassa 1900-luvun puolivälissä ja villit RJF-Kytkimet poistettiin niiden pesistä ja kotieläiminä pidetyt kanat hautoivat ne.

jotta voidaan määrittää ensisijainen RJF-alalaji, josta kotieläiminä pidetyt kanat on johdettu, ja ymmärtää kanojen kesyyntymisen taustalla olevat geneettiset mekanismit, on tarpeen analysoida sekä oletettujen luonnonvaraisten sukulaisten että kotieläiminä pidettyjen populaatioiden ydingenomit kaikkien RJF-alalajien luonnollisilla levinneisyysalueilla ja niiden ulkopuolella.

tutkimuksessa sekvensoitiin 787 kokonaista genomia: 627 kesykanaa, 142 RJF: ää, jotka edustavat kaikkia viittä alalajia, 12 vihreää viidakkokanaa, 2 harmaata viidakkokanaa ja 4 Ceylonin viidakkokanaa. Jotta RJF: n alalajien geneettisen vaihtelun todennäköisyys olisi mahdollisimman suuri, se otti näytteitä kuhunkin alalajiin kuuluvista yksilöistä vähintään kolmesta maantieteellisesti kaukaisesta paikasta ja varmisti, että vähintään yksi yksilö kustakin alalajista sekvensoitiin vähintään 20× peittoalueen tarkkuudella.

pääkomponenttianalyysi (PCA) korostaa myös RJF: n alalajien erottumista toisistaan. On mielenkiintoista, että jotkut G. G. murghi (jakautunut Pohjois-Intian niemimaalla) ja G. g. jabouillei (rajoittuu Etelä-Kiinaan ja Pohjois-Vietnamiin) yksilöt ryhmittyvät yhteen.

analyysit osoittavat, että kaikki RJF: n alalajit ovat geneettisesti eriytyneitä, jotka yleensä vastaavat niiden maantieteellisiä levinneisyysalueita ja taksonomisia luokituksia. Viidestä RJF: n alalajista G. G. spadiceus-lajin yksilöt ovat läheisintä sukua kaikille kotieläiminä pidetyille kanapopulaatioille

yhdistämällä kaikkien kotieläiminä pidettyjen kanojen monofyleettinen luonne, näiden analyysien tulokset viittaavat yhteisesti siihen, että kanat todennäköisesti kesytettiin RJF: n G. g. spadiceus-alalajin Holoseenissa.

”tuloksemme ovat ristiriidassa aiempien väitteiden kanssa, joiden mukaan kanat olisi kesytetty neoliittisessa Pohjois-Kiinassa ja Indus-laakson sivilisaatiossa (tehty Mohenjo-Daron paikalta Pakistanista löytyneiden epäiltyjen kanajäänteiden perusteella). PCA kuitenkin osoittaa, että G. G. murghin näytteet läntisimmästä Pohjois-Intiasta osoittivat syvempää eroa kanoista kuin G. G.murghin jäljellä olevat linnut, jotka oli kerätty Koillis-Intiasta”, luki lehdessä.