Kamelinfluenssa on MERS-epidemioiden keskiössä

Lähi-idän hengitysoireyhtymän pysyvyys Arabian niemimaalla on seurausta toistuvista piikeistä kameleissa haudotuissa uusissa viruskannoissa, uusi tutkimus osoittaa.

Saudi-Arabiassa vuonna 2012 puhjenneeseen MERS-Koronavirukseen on sairastunut yli 1 600 ihmistä, joista lähes 600 on kuollut. Suurin osa tapauksista iski Lähi-idässä, ja vaikka tartuntoja on raportoitu Euroopan, Aasian ja Afrikan maissa, ne ovat kaikki peräisin kyseiseltä alueelta.

lisääntyvä todistusaineisto on viitannut yksikyttyräisiin kameleihin väli-isäntinä Mersin leviämisessä, mutta tätä ei ole toistaiseksi määritelty. Asia on arka, koska eläimet ovat kulttuurisesti ja taloudellisesti merkittäviä alueelle.

nyt Saudi-Arabian, Egyptin, Australian ja Hongkongin tutkijaryhmän fylogeneettisessä analyysissä on tunnistettu viisi merkittävää MERS-CoV-sukua, jotka ovat yhteisiä sekä kameleille että ihmisille.

Science1-tiedejulkaisussa julkaistu tutkimus viittaa siihen, että useita MERS-CoV-kantoja esiintyi yhdessä suurella esiintyvyydellä ja että ne saivat usein samanaikaisia infektioita kameleilla, mikä tuotti uusia infektiorivejä.

ihmisen tartunta on tapahtunut erillisissä lähetyksissä jokaisessa vaiheessa, jossa kameleille on kehittynyt uusi linja.

”tämä paperi käsittelee laajimmin mers-koronaviruksen kehitystä kameleissa, jotka ovat aktiivisia isäntiä tämän viruksen levittämisessä ihmisiin. Työmme antaa selkeämmän kuvan MERS: n kehityksestä sen säiliöisännässä”, sanoo Hongkongin yliopiston kehittyvien tartuntatautien Valtion Avainlaboratorion ja Influenssatutkimuskeskuksen johtaja Yi Guan.

julkisista tietokannoista saadut Genomisekvenssit yhdistettiin 67 genomisekvenssiin, jotka oli sekvensoitu Jeddassa, Riadissa ja Taifissa toukokuun 2014 ja huhtikuun 2015 välisenä aikana teurastamoissa, maatiloilla tai tukkumarkkinoilla otetuista kameleista otetuista MERS-positiivisista näytteistä. Yli puolella näistä kameleista oli myös kamelialfa-koronavirustartunta, ja kahdella kameleista oli kolmas betakoronaviruksen rinnakkaisinfektio.

Saudi-Arabian kamelien MERS-CoV löytyi jokaisesta viidestä sukulinjasta.

pyyhkäisynäytteistä sekvensoidut virukset liittyivät uusimpaan sukulinjaan, ja ne osoittavat, että MERS-viruksen uusin versio, perimä 5, kehittyi kameleilla rekombinanttiviruksesta, joka koostui eri osista perimää 3 ja 4.

Lineage 5 liittyy viimeaikaisiin tartuntoihin Etelä-Koreassa, jossa mers-tauti puhkesi tämän vuoden toukokuusta heinäkuuhun, kun eräs potilas sairastui virukseen matkustaessaan Lähi-idässä ja sairastui palatessaan kotiin.

fylogeneettiset tiedot viittaavat siihen, että tähän potilaaseen tarttunut virus on saatu kameleista, koska se muistuttaa suuresti tutkimusryhmän maaliskuussa 2015 ottamaa kamelivirusta, joskaan tartunnan tarkat yksityiskohdat eivät ole selvillä.

”tämä paperi todella yksiselitteisesti vahvistaa dromedaarikamelien roolin Mers-Covin ylläpidossa Arabian niemimaalla viime vuosina. Se osoittaa, että ihmisten tapaukset vuodesta 2013 lähtien ovat johtuneet toistuvista hypyistä kameleilta, joiden tarttuvuus on rajoittunut ihmisestä toiseen, sanoo Edinburghin yliopiston Molecular Evolution-tutkimuksen henkilökohtainen puheenjohtaja Andrew Rambaut.

Tämä tutkimus tarkoittaa sitä, että tällä kaudella paras torjuntamuoto MERSILLE on viruksen hallinta kamelipopulaatioissa ja ihmisen vuorovaikutus niiden kanssa.

”MERS-virus on levinnyt laajalle kameleilla ja yleisempi nuoremmilla kameleilla”, Yi Guan sanoo. ”Tämä korostaa selvästi sitä, että varsinkin nuoret kamelit ja ihmiset on erotettava paremmin toisistaan. Tehostetut karanteeni-ja bioturvallisuustoimenpiteet olisi pantava täytäntöön.”

Yi Guan lisää, että Mersin kaltaisia viruksia näyttää esiintyneen kameleissa jo jonkin aikaa”, joten on tutkittava, mikä johti näiden ihmisten infektioiden ilmaantumiseen ja miksi tämä virus aiheuttaa niin vakavan sairauden.”

mutta Andrew Rambautin mukaan avain MERS — järjestelmän perusteiden ymmärtämiseen eteenpäin on taudin tutkiminen karjan tautina-rutiinilla ja viruksen jatkuvalla seurannalla kameleissa.