nukleosomin rakenne David Marcey © 2020

I. Johdanto
II. Histonioktameeri
III. DNA: n Superhelix
IV. viitteet
ohjeet

jätä kommentteja/ehdotuksia tai vahvista tämän sivuston käyttö käymällä palautesivullamme

tämä näyttely esittelee molekyylejä ruudun vasemmassa osassa ja tekstiä, joka käsittelee molekyylien rakenne-funktiosuhteita oikeassa osassa (alla). Käytä oikealla olevaa vierityspalkkia vierittääksesi tekstiä. Jos käytät muuta selainta kuin Firefoxia (suositeltu selain tälle sivustolle), muista sallia ponnahdusikkunat. Chromessa voit klikata popup blocker-kuvaketta osoiterivin oikeassa osassa..
herättääksesi molekyylin renderoinnit, jotka kuvaavat tiettyjä kohtia, Napsauta radiopainikkeita:

Napsauta load PDB-painikkeita,, kun niitä on.

nollataksesi molekyylin, käytä nollauspainikkeita:

Jos muutat selainikkunasi kokoa, päivitä sivu palauttaaksesi oikean katselun.

I. Johdanto

nukleosomin ydinhiukkasessa on kaksi kopiota kutakin histoniproteiinia (H2A, H2B, H3 ja H4) ja 146 basepairia (bp) superheliaalista DNA: ta tämän histonioktameerin ympärillä. Se edustaa DNA: n pakkausten ensimmäistä järjestystä tumassa ja on siten pääasiallinen rakenne, joka määrittää DNA: n esteettömyyden.

palaa alkuun

kaksi kopiota kustakin histoniproteiinista, H2A, H2B, H3 ja H4, kootaan oktamerikiekoksi. Vaikka jokaisella monomeerilla on n-terminaalinen pyrstö, joka projisoituu histoniytimestä, vasemmanpuoleisessa rakenteessa näkyy vain yksi pyrstö yhdestä H3-monomeerista.

kaikilla neljällä histoniproteiinilla on hyvin samankaltainen rakenteellinen motiivi, histonipoimu, joka koostuu kolmesta kahden silmukan yhdistämästä alfa-kierteestä (esitetty tässä H2A: lle):
alpha1-loop1-alpha2 – loop2-alpha3.

histonioktomeeri koostuu neljästä Histoni-heterodimeeristä: kahdesta kummastakin H3-H4: stä ja H2A-H2B: stä.

heterodimeerien histonipoimuaiheet ovat järjestyneet siten, että yhden monomeerin silmukka 1 on tiiviisti rinnastettu toisen monomeerin loop2: een, joka on esitetty tässä H3-H4-heterodimeerille. Symmetria-akseli kulkee kahden monomeerin kahden pitkän alfa2-heliksen välillä.

H3-H4-heterodimeeripari muodostaa tetrameerin nelikiertoisen kimpun vuorovaikutusten avulla (H3: n alpha2 ja alpha3 kustakin dimeeristä). Tämän (H3-H4)2-tetrameerin liittyminen DNA: han on ensimmäinen vaihe nukleosomin kokoamisessa.

jokainen H2A-H2B-heterodimeeri sitoutuu (H3-H4)2-tetrameeriin toisen, homologisen nelikiertokimpun kautta (alpha2 ja alpha3 sekä H2B että H4) liittyen H2B-ja H4-histonipoimuihin.

palaa alkuun

III. DNA: n Superhelix

146 bp kaksoiskierteistä DNA: ta kietoutuu histonioktameerin ympärille superhelixissä.

kaksiosainen symmetria-akseli sijoittuu H3-H4-heterodimeerien ja H2A-H2B-heterodimeerien väliin.

tämä symmetria-akseli leikkaa yhden bp: n superhelixin keskustassa jakaen 146 bp: n DNA: n 72 bp: n ja 73 bp: n puolikkaisiin, jotka määritellään Keskisen bp: n mukaan.

vasenkätinen DNA-superhelix kiertää histoniytimen ympäri 1,65 kierrosta.