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Inmitten dieser bahnbrechenden Arbeit wurde Turing tot in seinem Bett entdeckt, vergiftet mit Zyanid. Das offizielle Urteil war Selbstmord, aber bei der Untersuchung von 1954 wurde kein Motiv festgestellt. Sein Tod wird oft der Hormonbehandlung zugeschrieben, die er von den Behörden erhielt, nach seinem Prozess wegen Schwulsein. Doch er starb mehr als ein Jahr nach dem Ende der Hormondosen; und auf jeden Fall hatte der widerstandsfähige Turing diese grausame Behandlung mit dem ertragen, was sein enger Freund Peter Hilton ‚amüsierte Standhaftigkeit‘ nannte. Das Selbstmordurteil wird nun ernsthaft angefochten. Nach den Aufzeichnungen der Untersuchung zu urteilen, wurden überhaupt keine Beweise vorgelegt, die darauf hindeuten, dass Turing beabsichtigte, sich das Leben zu nehmen, noch dass das Gleichgewicht seines Geistes gestört war (wie der Gerichtsmediziner behauptete). Eigentlich, sein geistiger Zustand scheint zu der Zeit unauffällig gewesen zu sein. Während Selbstmord nicht ausgeschlossen werden kann, ist es auch möglich, dass Turings Tod einfach ein Unfall war, das Ergebnis seines Einatmens von Zyaniddämpfen aus einem Experiment in dem winzigen Labor neben seinem Schlafzimmer. Ein Mord durch die Geheimdienste kann auch nicht völlig ausgeschlossen werden, da Turing zu einer Zeit, als Homosexuelle als Bedrohung der nationalen Sicherheit angesehen wurden, so viel über die Kryptoanalyse der Alliierten wusste.

Im 21.Jahrhundert war Turings Anklage wegen Schwulsein berüchtigt geworden. Im Jahr 2009 entschuldigte sich der damalige Premierminister Gordon Brown im Namen der britischen Regierung öffentlich für Turings ‚völlig unfaire‘ Behandlung. Vier Jahre später gewährte Königin Elizabeth II. Turing eine königliche Begnadigung.Turing war ein weitsichtiges Genie und seine Forschung hatte eine bemerkenswerte Breite, die über Mathematik und die Grundlagen der Mathematik, mathematische Logik, Kryptoanalyse, Computerdesign, mechanische Methoden in der Mathematik, die Natur von Intelligenz und Geist und die Mechanismen des biologischen Wachstums. Sein Werk ist durch ein übergeordnetes Thema vereint – seine Untersuchung (wie Max Newman es ausdrückte) ‚das Ausmaß und die Grenzen mechanistischer Erklärungen‘.