IMGT Aide-mémoire
Ladung, Wasserstoffdonor- und Akzeptoratome und Polarität der Aminosäureseitenketten
- Ladung der Aminosäureseitenketten
- Wasserstoffdonor- und Akzeptoratome der Aminosäureseitenketten
- Polarität der Aminosäureseitenketten
Ladung der Aminosäureseitenketten
Geladene Seitenketten/h4>
Die Ladung an der Aminosäureseitenkette hängt von der pK der AA (Tabelle 1) und vom pH-Wert der Lösung ab.
- Negativ geladen (saure Seitenketten): asparaginsäure und Glutaminsäure
Bei einem pH-Wert, der ihrer pK überlegen ist (Tabelle 2), verlieren die Carboxylicside-Ketten ein H + -Ion (Proton) und sind negativ geladen. Sie sind daher sauer.
Bei einem pH-Wert unter ihrer pK sind die Asparaginsäure- und Glutaminsäure-Seitenketten ungeladen.
- Positiv geladen (basische Seitenketten): Lysin, Arginin und Histidin
Bei einem pH-Wert, der ihrer pK überlegen ist (Tabelle 2), sind die Aminseitenketten ungeladen.
Bei einem pH-Wert unter ihrer pK akzeptieren die Lysin-, Arginin- und Histidinin-Ketten ein H + -Ion (Proton) und sindpositiv geladen. Sie sind daher grundlegend.
Tabelle 1: pK der Aminosäureseitenkettengruppe.Die pK der Seitenkettengruppe ist der pH-Wert, bei dem genau die Hälfte einer Carboxyl- oder Amingruppe geladen ist.
| Aminosäure | pK der Seitenkettengruppe |
|---|---|
| Asparaginsäure | 3,9 |
| Glutaminsäure | 4,2 |
| Lysin | 10,5 |
| Arginin | 12,5 |
| Histidin | 6.0 |
Die Arginin-Seitenkette ist sehr einfach, da ihre positive Ladung durch Resonanz stabilisiert wird.
Die beiden Stickstoffatome der Histidin-Seitenkette haben eine relativ schwache Affinität zu einem H+und sind bei neutralem pH-Wert nur teilweise positiv.
Tabelle 2: Ladung der Aminosäureseitenketten.Es werden nur die Seitenketten angezeigt.
Bei pH=7 sind Seitenketten der 5 Aminosäuren geladen.
Ungeladene Seitenketten
Fünfzehn AA haben ungeladene Seitenketten. Sie sind: A, N, C, Q, G, I, L, M, F, P, S, T, W, Y, V.
Wasserstoffdonor- und Akzeptoratome der Aminosäureseitenketten
Klicken Sie hier für die Nomenklatur der Aminosäurenatome.
- 3 Aminosäuren (Arginin, Lysin und Tryptophan) haben Wasserstoffdonoratome in ihren Seitenketten.
- 2 Aminosäuren (Asparaginsäure, Glutaminsäure) haben Wasserstoffakzeptoratome in ihrer Seitenkette.
- 6 Aminosäuren (Asparagin, Glutamin, Histidin, Serin, Threonin und Tyrosin) haben sowohl Wasserstoff-Donor- als auch Akzeptoratome in ihren Seitenketten.
Tabelle 3: Wasserstoffdonor- und Akzeptoratome in Aminosäureseitenketten.
a In Klammern die Anzahl der „sp-Wasserstoffatome“, die ein Spenderatom spenden kann, wenn mehr als eines vorhanden ist.
b Zwischen Klammern, Anzahl der Wasserstoffbrückenbindungen, die ein Akzeptoratom akzeptieren kann, wenn mehr als eine.
- 9 Aminosäuren (Alanin, Cystein, Glycin, Isoleucin, Leucin, Methionin, Phenylalanin, Prolin, Valin) haben keine Wasserstoffdonor- oder Akzeptoratome in ihren Seitenketten.
Polarität der Aminosäureseitenketten
Aminosäureseitenketten mit Wasserstoffdonor- und/oder Akzeptoratomen sind polar
Aminosäureseitenketten ohne Wasserstoffdonor- und/oder Akzeptoratome sind unpolar
Es gibt 10 unpolare Aminosäuren (einschließlich des Tryptophans trotz Wasserstoffdonoratom): A, C, G, I, L, M, F, P, V, W.
Diese unpolaren Aminosäuren:
- neigen dazu, ihre Seitenketten im Inneren von Proteinen zu bündeln.
- sind häufig in Van-der-Waals-Interaktionen involviert.
Gepaarte Cysteine erlauben Disulfidbindungen.