Nucleosome Structuur David Marcey © 2020

Inleiding
II. De Histon Octamer
III. De DNA-Superhelix
IV. Referenties
Routebeschrijving

laat opmerkingen/suggesties of bevestig het gebruik van deze site door uw bezoek aan onze feedback pagina

Deze tentoonstelling toont moleculen in het linker gedeelte van het scherm, en de tekst die adressen structuur-functie relaties van de moleculen in het rechter gedeelte (onderaan). Gebruik de schuifbalk rechts om door de tekst te bladeren. Als u gebruik maakt van een andere browser dan Firefox (de aanbevolen browser voor deze site), moet u pop-ups toestaan. In Chrome, u kunt klikken op de pop-up blocker pictogram in het rechter deel van de adresbalk..
om weergaven op te roepen van het molecuul dat bepaalde punten illustreert, klikt u op de keuzerondjes:

klik op de PDB-knoppen laden, indien aanwezig.

om het molecuul te resetten, gebruik je de resetknoppen:

als je het formaat van je browservenster wijzigt, vernieuw je de pagina om de juiste weergave te herstellen.

I. Inleiding

het nucleosoomkerndeeltje bevat twee kopieën van elk Histon-eiwit (H2A, H2B, H3 en H4) en 146 basepairs (bp) van superhelisch DNA rond dit Histon-octamer. Het vertegenwoordigt de eerste orde van DNA-verpakking in de kern en als zodanig is de belangrijkste structuur die de toegankelijkheid van DNA bepaalt.

keer terug naar begin

twee kopieën van elk histoneiwit, H2A, H2B, H3 en H4, worden samengevoegd tot een octamerische schijf. Hoewel elk monomeer een n-terminale staart heeft die vanuit de histonkern projecteert, toont de structuur links slechts één enkele staart van één H3-monomeer.

alle vier histoneiwitten hebben een sterk vergelijkbaar structureel motief, de histonplooi, bestaande uit drie Alfa-helices die met elkaar verbonden zijn door twee lussen (hier afgebeeld voor H2A):
alpha1-loop1-alpha2 – loop2-alpha3.

het Histon-octomeer bestaat uit vier Histon-heterodimers: twee van elk H3-H4 en H2A-H2B.

De Histon – vouwmotieven van de heterodimers zijn gerangschikt met de loop1 van een monomeer dicht naast de loop2 van het tweede monomeer, hier afgebeeld voor een H3-H4 heterodimer. Een as van symmetrie gaat tussen de twee lange alfa2-helices van de twee monomeren.

het H3-H4 heterodimer paar om een tetramer te vormen door interacties van een vier-helix bundel (alpha2 en alpha3 van H3 van elk dimeer). De associatie van dit (H3-H4)2 tetrameer met DNA is de eerste stap in nucleosome assemblage.

elk H2A-H2B heterodimer bindt aan het (H3-H4)2-tetrameer via een andere, homologe, vier helixbundel (alpha2 en alpha3 van zowel H2B als H4), die de H2B-en H4-histonplooien verbindt.

keer terug naar begin

III. de DNA-Superhelix

146 bp dubbel spiraalvormig DNA wordt om het Histon-octamer gewikkeld in een superhelix.

een tweevoudige symmetrieas valt tussen de H3-H4 heterodimers en de H2A-H2B heterodimers.

Deze as van symmetrie snijdt een enkele bp in het centrum van de superhelix, waarbij het 146 BP DNA wordt gedeeld in 72 BP en 73 BP helften gedefinieerd door de centrale bp.

De linkshandig DNA superhelix wikkelt in 1,65 bochten rond de histonkern.